PDB-2j5t: Glutamate 5-kinase from Escherichia coli complexed with glutamate

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 2j5t

タイトル

Glutamate 5-kinase from Escherichia coli complexed with glutamate

要素

GLUTAMATE 5-KINASE

キーワード

TRANSFERASE / PROLINE BIOSYNTHESIS / FEEDBACK REGULATION

機能・相同性

機能・相同性情報

proline binding / glutamate 5-kinase / glutamate 5-kinase activity / L-proline biosynthetic process / proline biosynthetic process / magnesium ion binding / protein homodimerization activity / RNA binding / ATP binding / identical protein binding / cytosol
類似検索 - 分子機能

生物種

ESCHERICHIA COLI (大腸菌)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.9 Å

データ登録者

Marco-Marin, C. / Gil-Ortiz, F. / Perez-Arellano, I. / Cervera, J. / Fita, I. / Rubio, V.

引用

ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 2007
タイトル: A Novel Two-Domain Architecture within the Amino Acid Kinase Enzyme Family Revealed by the Crystal Structure of Escherichia Coli Glutamate 5-Kinase.
著者: Marco-Marin, C. / Gil-Ortiz, F. / Perez-Arellano, I. / Cervera, J. / Fita, I. / Rubio, V.

履歴

登録	2006年9月19日	登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE
改定 1.0	2007年3月6日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2011年7月13日	Group: Advisory / Version format compliance
改定 1.2	2023年12月13日	Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Other / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_database_status / pdbx_initial_refinement_model / struct_conn / struct_ncs_dom_lim Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_database_status.status_code_sf / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id / _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id

Remark 650

HELIX DETERMINATION METHOD: AUTHOR PROVIDED.

Remark 700

SHEET DETERMINATION METHOD: AUTHOR PROVIDED.

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

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PDB形式	pdb2j5t.ent.gz	427.8 KB	表示	PDB形式
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その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	2j5t_validation.pdf.gz	540.3 KB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	2j5t_full_validation.pdf.gz	579.8 KB	表示
XML形式データ	2j5t_validation.xml.gz	93.7 KB	表示
CIF形式データ	2j5t_validation.cif.gz	123.3 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/j5/2j5t ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/j5/2j5t	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	2j5vSC S: 精密化の開始モデル C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	1i1e-d 6oct-d 1s0g-d 1epw-d 1s0b-d 1g9a-d 1s0d-d 0556 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#116 - 2009年8月硫酸転移酵素 (Sulfotransferases) 類似性 (1) #235 - 2019年7月 AMPA受容体 (AMPA Receptor) 類似性 (1) #191 - 2015年11月グルタミン酸開閉型塩化物イオン受容体 (Glutamate-gated Chloride Receptors) 類似性 (1)

登録構造単位

A: GLUTAMATE 5-KINASE

B: GLUTAMATE 5-KINASE

C: GLUTAMATE 5-KINASE

D: GLUTAMATE 5-KINASE

E: GLUTAMATE 5-KINASE

F: GLUTAMATE 5-KINASE

G: GLUTAMATE 5-KINASE

H: GLUTAMATE 5-KINASE

ヘテロ分子

316 kDa, 8 ポリマー
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1

A: GLUTAMATE 5-KINASE

B: GLUTAMATE 5-KINASE

C: GLUTAMATE 5-KINASE

D: GLUTAMATE 5-KINASE

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
158 kDa, 4 ポリマー
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2

E: GLUTAMATE 5-KINASE

F: GLUTAMATE 5-KINASE

G: GLUTAMATE 5-KINASE

H: GLUTAMATE 5-KINASE

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
158 kDa, 4 ポリマー
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3

A: GLUTAMATE 5-KINASE

B: GLUTAMATE 5-KINASE

ヘテロ分子

ソフトウェアが定義した集合体
79.1 kDa, 2 ポリマー
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4

G: GLUTAMATE 5-KINASE

H: GLUTAMATE 5-KINASE

ヘテロ分子

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78.9 kDa, 2 ポリマー
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5

E: GLUTAMATE 5-KINASE

F: GLUTAMATE 5-KINASE

ヘテロ分子

ソフトウェアが定義した集合体
79.2 kDa, 2 ポリマー
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6

C: GLUTAMATE 5-KINASE

D: GLUTAMATE 5-KINASE

ヘテロ分子

ソフトウェアが定義した集合体
79 kDa, 2 ポリマー
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単位格子

Length a, b, c (Å)	96.302, 124.108, 144.927
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 93.96, 90.00
Int Tables number	4
Space group name H-M	P12₁1

非結晶学的対称性 (NCS)

NCSドメイン:

ID	Ens-ID	詳細
1	1	A
2	1	B
3	1	C
4	1	D
5	1	E
6	1	F
7	1	G
8	1	H

NCSドメイン領域:

Component-ID: 1 / Ens-ID: 1 / Beg auth comp-ID: ASP / Beg label comp-ID: ASP / End auth comp-ID: ARG / End label comp-ID: ARG / Refine code: 4 / Auth seq-ID: 3 - 367 / Label seq-ID: 3 - 367

Dom-ID	Auth asym-ID	Label asym-ID
1	A	A
2	B	B
3	C	C
4	D	D
5	E	E
6	F	F
7	G	G
8	H	H

NCS oper:

ID	Code	Matrix	ベクター
1	given	(0.66619, -0.73797, -0.1077), (-0.73427, -0.67431, 0.07849), (-0.13054, 0.02679, -0.99108)	-11.40808, -62.97409, 229.03127
2	given	(-0.72894, 0.6755, -0.11113), (0.67664, 0.68628, -0.26677), (-0.10394, -0.26965, -0.95733)	118.03104, -13.79059, 208.95186
3	given	(-0.96598, 0.05816, 0.252), (0.0324, -0.93949, 0.34104), (0.25658, 0.3376, 0.90564)	-8.38251, -72.63773, 19.70603
4	given	(-0.97127, -0.02003, 0.23712), (0.07398, -0.9725, 0.22086), (0.22617, 0.23206, 0.94604)	53.74158, -127.41484, 8.55533
5	given	(-0.68675, 0.69979, -0.19668), (0.70834, 0.58351, -0.3972), (-0.16319, -0.41209, -0.89641)	36.20375, -0.11562, 205.43961
6	given	(0.99999, -0.00464, 0.00166), (0.0047, 0.99901, -0.04425), (-0.00145, 0.04426, 0.99902)	65.06425, -58.88403, 7.47517
7	given	(0.64914, -0.75674, -0.07716), (-0.75337, -0.65361, 0.07227), (-0.10512, 0.01122, -0.9944)	74.88105, -66.88284, 211.58546

詳細

CONTACTS BETWEEN DIMERS ARE WEAK, BUT GEL FILTRATION EXPERIMENTS SHOW THAT THE PROTEIN IS TETRAMERIC AND THE TETRAMERS FORMED IN THE CRYSTAL ARE EQUIVALENT TO THOSE FOUNDIN A DIFFERENT CRYSTAL OF THIS PROTEIN (WITH DIFFERENT SPACEGROUP).

-
タンパク質 , 1種, 8分子 ABCDEFGH

#1: タンパク質	GLUTAMATE 5-KINASE / GAMMA-GLUTAMYL KINASE / GK 分子量: 39089.430 Da / 分子数: 8 / 変異: YES / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ESCHERICHIA COLI (大腸菌) / 株: DH5ALPHA / プラスミド: PET22B / 発現宿主: ESCHERICHIA COLI (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21(DE3) / 参照: UniProt: P0A7B5, glutamate 5-kinase

-
非ポリマー , 5種, 151分子

#2: 化合物	ChemComp-GLU / GLUTAMIC ACID / グルタミン酸タイプ: L-peptide linking / 分子量: 147.129 Da / 分子数: 12 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₅H₉NO₄
#3: 化合物	ChemComp-SO4 / SULFATE ION / 硫酸ジアニオン分子量: 96.063 Da / 分子数: 8 / 由来タイプ: 合成 / 式: SO₄
#4: 化合物	ChemComp-CL / CHLORIDE ION / クロリド分子量: 35.453 Da / 分子数: 20 / 由来タイプ: 合成 / 式: Cl
#5: 化合物	ChemComp-MG / MAGNESIUM ION / マグネシウムジカチオン分子量: 24.305 Da / 分子数: 8 / 由来タイプ: 合成 / 式: Mg
#6: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 103 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
詳細

構成要素の詳細	ENGINEERED RESIDUE IN CHAIN A, ILE 129 TO VAL ENGINEERED RESIDUE IN CHAIN B, ILE 129 TO VAL ...ENGINEERED RESIDUE IN CHAIN A, ILE 129 TO VAL ENGINEERED RESIDUE IN CHAIN B, ILE 129 TO VAL ENGINEERED RESIDUE IN CHAIN C, ILE 129 TO VAL ENGINEERED RESIDUE IN CHAIN D, ILE 129 TO VAL ENGINEERED RESIDUE IN CHAIN E, ILE 129 TO VAL ENGINEERED RESIDUE IN CHAIN F, ILE 129 TO VAL ENGINEERED RESIDUE IN CHAIN G, ILE 129 TO VAL ENGINEERED RESIDUE IN CHAIN H, ILE 129 TO VAL

構成要素の詳細

ENGINEERED RESIDUE IN CHAIN A, ILE 129 TO VAL ENGINEERED RESIDUE IN CHAIN B, ILE 129 TO VAL ...

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.77 Å³/Da / 溶媒含有率: 55.2 %
結晶化	pH: 6.5 / 詳細: 1.45 M MGSO4, 20 MM CACL2, 0.1 M MES PH 6.5.

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: ESRF / ビームライン: ID14-4 / 波長: 0.979
検出器	タイプ: ADSC CCD / 検出器: CCD / 日付: 2005年2月6日 / 詳細: TOROIDAL MIRRORS
放射	モノクロメーター: SI(111) AND SI (311) / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.979 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 2.9→50 Å / Num. obs: 74908 / % possible obs: 99.3 % / Observed criterion σ(I): 2.9 / 冗長度: 4.5 % / R_merge(I) obs: 0.16 / Net I/σ(I): 9.7
反射シェル	解像度: 2.9→3.06 Å / 冗長度: 4.6 % / R_merge(I) obs: 0.49 / Mean I/σ(I) obs: 2.9 / % possible all: 99.6

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
REFMAC	5.2.0005	精密化
MOSFLM		データ削減
SCALA		データスケーリング
MOLREP		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: PARTIALLY-REFINED MODEL OF PBD ENTRY 2J5V

2j5v

解像度: 2.9→25 Å / Cor.coef. F_o:F_c: 0.92 / Cor.coef. F_o:F_c free: 0.874 / SU B: 35.798 / SU ML: 0.302 / TLS residual ADP flag: LIKELY RESIDUAL / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R Free: 0.401 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD
詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS. THE FINAL STRUCTURE ENCOMPASSES THE ENTIRE POLYPEPTIDE CHAIN FROM RESIDUE 3 IN SUBUNITS D AND E, BUT LACKS THE FOLLOWING RESIDUES IN THE ...

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.246	3771	5 %	RANDOM
R_work	0.197	-	-	-
obs	0.199	70989	99.2 %	-

溶媒の処理

イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK

原子変位パラメータ

B_iso mean: 24.57 Å²

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	-2.13 Å²	0 Å²	0.38 Å²
2-	-	3.82 Å²	0 Å²
3-	-	-	-1.63 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2.9→25 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	21321	0	188	103	21612

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	Dev ideal target	数
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_refined_d	0.009	0.021	21752
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_other_d	0.002	0.02	20630
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_refined_deg	1.159	1.971	29455
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_other_deg	0.745	3	47605
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_1_deg	5.796	5	2826
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_2_deg	39.96	23.516	930
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_3_deg	17.532	15	3669
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_4_deg	15.682	15	205
X-RAY DIFFRACTION	r_chiral_restr	0.061	0.2	3471
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_refined	0.003	0.02	24490
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_other	0.001	0.02	4227
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_refined	0.198	0.2	4369
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_other	0.176	0.2	20330
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_refined	0.164	0.2	10448
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_other	0.083	0.2	12845
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_refined	0.135	0.2	455
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_other
X-RAY DIFFRACTION	r_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_refined	0.261	0.2	46
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_other	0.185	0.2	156
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_refined	0.214	0.2	12
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_it	0.52	1.5	18189
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_other
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_it	0.538	2	22421
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_other
X-RAY DIFFRACTION	r_scbond_it	0.774	3	8407
X-RAY DIFFRACTION	r_scbond_other
X-RAY DIFFRACTION	r_scangle_it	1.281	4.5	7034
X-RAY DIFFRACTION	r_scangle_other
X-RAY DIFFRACTION	r_long_range_B_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_long_range_B_other
X-RAY DIFFRACTION	r_rigid_bond_restr
X-RAY DIFFRACTION	r_sphericity_free
X-RAY DIFFRACTION	r_sphericity_bonded

Refine LS restraints NCS

Ens-ID: 1 / 数: 4994 / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

Dom-ID	Auth asym-ID	タイプ	Rms dev position (Å)	Weight position
1	A	medium positional	0.41	0.5
2	B	medium positional	0.42	0.5
3	C	medium positional	0.37	0.5
4	D	medium positional	0.34	0.5
5	E	medium positional	0.37	0.5
6	F	medium positional	0.29	0.5
7	G	medium positional	0.38	0.5
8	H	medium positional	0.34	0.5
1	A	medium thermal	0.24	2
2	B	medium thermal	0.16	2
3	C	medium thermal	0.18	2
4	D	medium thermal	0.2	2
5	E	medium thermal	0.21	2
6	F	medium thermal	0.21	2
7	G	medium thermal	0.23	2
8	H	medium thermal	0.17	2

LS精密化シェル

解像度: 2.9→2.97 Å / Total num. of bins used: 20 /

	R_factor	反射数
R_free	0.345	267
R_work	0.276	5142

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	1.6457	-0.005	-0.1954	0.1581	0.1187	0.7771	-0.0108	0.014	0.0629	-0.007	0.0028	-0.0159	-0.0593	0.031	0.008	-0.1439	0.025	0.0236	-0.2437	0.012	-0.1758	67.3903	-61.9739	93.8984
2	1.8786	-0.6032	-0.136	1.0951	0.5331	1.1709	-0.1266	-0.766	-0.0343	0.3585	0.1464	-0.0792	0.2948	0.2119	-0.0198	-0.0191	0.0877	-0.0293	0.1217	0.0185	-0.1064	69.4179	-62.4212	125.6015
3	0.3697	-0.108	-0.3964	1.0122	0.4504	1.6128	0.0783	-0.0661	0.1364	0.0299	-0.1408	0.1667	-0.2369	-0.2832	0.0625	-0.0101	0.0349	0.0339	-0.0769	-0.0629	-0.0452	16.2667	-36.2343	128.7095
4	1.5548	0.3099	0.101	0.406	0.1101	0.538	0.018	0.0423	0.2368	0.0054	-0.046	0.1397	0.0038	-0.19	0.028	-0.083	0.0345	-0.0035	-0.092	-0.0283	-0.0437	10.7729	-44.5672	98.1857
5	1.4779	-0.2524	-0.1353	0.512	0.2297	0.9778	0.0038	0.2297	-0.0919	-0.0353	-0.0819	0.1517	0.0551	-0.1043	0.078	-0.1162	0.0195	-0.0251	-0.1365	-0.0444	-0.0759	-53.935	18.9437	89.7171
6	1.6093	-0.761	0.1712	1.162	-0.1345	1.3058	-0.155	-0.2346	0.0601	0.1321	0.0988	0.0937	-0.1777	-0.045	0.0563	-0.0355	0.0294	0.0013	-0.1808	-0.0156	-0.1485	-47.0219	31.7435	118.5264
7	2.3663	-0.2767	0.0135	0.1828	0.0807	0.5812	-0.0911	-0.0748	-0.0372	0.0395	-0.0143	0.0486	0.0041	0.0689	0.1054	-0.1095	0.0437	0.0343	-0.2154	-0.0012	-0.15	2.2212	0.7824	86.3597
8	2.0187	-1.6088	-0.1633	1.2993	0.0843	0.6212	-0.366	-0.8921	0.0676	0.4392	0.3804	-0.2231	0.1522	0.1026	-0.0144	0.0978	0.1918	-0.0231	0.2121	-0.0395	0.0783	4.2463	1.5253	117.0851
9	0.0025	-0.0115	0.0034	0.0542	-0.0161	0.0048	-0.006	0.0378	-0.0255	0.056	-0.0001	0.0299	-0.0124	-0.0221	0.0061	-0.0002	-0.0012	-0.0001	0.0006	0.0001	0.0004	14.1423	-20.4832	103.1232

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	A	3 - 367
2	X-RAY DIFFRACTION	2	B	3 - 367
3	X-RAY DIFFRACTION	3	C	3 - 367
4	X-RAY DIFFRACTION	4	D	3 - 367
5	X-RAY DIFFRACTION	5	E	3 - 367
6	X-RAY DIFFRACTION	6	F	3 - 367
7	X-RAY DIFFRACTION	7	G	3 - 367
8	X-RAY DIFFRACTION	8	H	3 - 367
9	X-RAY DIFFRACTION	9	A	2001 - 2017
10	X-RAY DIFFRACTION	9	B	2001 - 2008
11	X-RAY DIFFRACTION	9	C	2001 - 2010
12	X-RAY DIFFRACTION	9	D	2001 - 2014
13	X-RAY DIFFRACTION	9	E	2001 - 2014
14	X-RAY DIFFRACTION	9	F	2001 - 2012
15	X-RAY DIFFRACTION	9	G	2001 - 2013
16	X-RAY DIFFRACTION	9	H	2001 - 2015

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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