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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2hlt | ||||||
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タイトル | Solution Structure of Bacillus subtilis Acylphosphatase | ||||||
要素 | Probable acylphosphatase | ||||||
キーワード | HYDROLASE / alpha/beta sandwich | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 | ||||||
生物種 | Bacillus subtilis (枯草菌) | ||||||
手法 | 溶液NMR / distance geometry, simulated annealing | ||||||
データ登録者 | Xia, B. / Hu, J.C. | ||||||
引用 | ジャーナル: To be Published タイトル: Solution Structure of Bacillus subtilis Acylphosphatase in free and bound states 著者: Xia, B. / Hu, J.C. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 2hlt.cif.gz | 568.8 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb2hlt.ent.gz | 482.8 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 2hlt.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 2hlt_validation.pdf.gz | 363.1 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 2hlt_full_validation.pdf.gz | 440.4 KB | 表示 | |
XML形式データ | 2hlt_validation.xml.gz | 24.8 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 2hlt_validation.cif.gz | 45.2 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/hl/2hlt ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/hl/2hlt | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 10332.688 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Bacillus subtilis (枯草菌) / プラスミド: pET-21a / 生物種 (発現宿主): Escherichia coli / 発現宿主: Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21 (DE3) / 参照: UniProt: O35031, acylphosphatase |
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#2: 化合物 | ChemComp-PO4 / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||
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NMR実験 |
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-試料調製
詳細 | 内容: 0.5mM BsAcP, U-15N,13C; 50mM PBS buffer; 0.03% (w/v) NaN3; 90% H2O, 10% D2O 溶媒系: 90% H2O/10% D2O |
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試料状態 | イオン強度: 50mM / pH: 7.0 / 圧: 1 atm / 温度: 298 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker AVANCE / 製造業者: Bruker / モデル: AVANCE / 磁場強度: 600 MHz |
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-解析
NMR software |
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精密化 | 手法: distance geometry, simulated annealing / ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | ||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |