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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2fxy | ||||||
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タイトル | Solution structure of 55-72 segment of staphylococcal nuclease | ||||||
![]() | 18-mer peptide from Thermonuclease | ||||||
![]() | HYDROLASE / SNase(55-72) / solution structure | ||||||
機能・相同性 | ![]() endonuclease activity, active with either ribo- or deoxyribonucleic acids and producing 3'-phosphomonoesters / micrococcal nuclease / nucleic acid binding / extracellular region / membrane / metal ion binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
手法 | 溶液NMR / torsion angle dynamics | ||||||
![]() | Wang, M. / Shan, L. / Wang, J.F. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Two peptide fragments G55-I72 and K97-A109 from staphylococcal nuclease exhibit different behaviors in conformational preferences for helix formation 著者: Wang, M. / Shan, L. / Wang, J.F. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 78.3 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 54.3 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 333.6 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 403.3 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 4.9 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 7.4 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質・ペプチド | 分子量: 1953.305 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 詳細: The peptide was chemically synthesized. The sequence of the peptide is naturally found in Staphylococcus aureus. 参照: UniProt: P00644, UniProt: Q1WCB7*PLUS, micrococcal nuclease |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||
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NMR実験 |
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試料調製
詳細 |
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試料状態 | イオン強度: 0 / pH: 5.0 / 圧: ambient / 温度: 298 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker DMX / 製造業者: Bruker / モデル: DMX / 磁場強度: 600 MHz |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: torsion angle dynamics / ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | ||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 80 / 登録したコンフォーマーの数: 15 |