登録情報 | データベース: PDB / ID: 2ex9 |
---|
タイトル | Crystal structure of penicillin binding protein 4 (dacB) from Escherichia coli, complexed with penicillin-V |
---|
要素 | Penicillin-binding protein 4 |
---|
キーワード | HYDROLASE / penicillin-binding protein / penicillin-V / cephem / penem / D-alanyl-D-alanine-carboxypeptidase / D-alanyl-D-alanine-endopeptidase |
---|
機能・相同性 | 機能・相同性情報
serine-type carboxypeptidase activity / peptidoglycan metabolic process / serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase / serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase activity / penicillin binding / 加水分解酵素; プロテアーゼ; ペプチド結合加水分解酵素; セリンエンドペプチターゼ / peptidoglycan biosynthetic process / carboxypeptidase activity / cell wall organization / regulation of cell shape ...serine-type carboxypeptidase activity / peptidoglycan metabolic process / serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase / serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase activity / penicillin binding / 加水分解酵素; プロテアーゼ; ペプチド結合加水分解酵素; セリンエンドペプチターゼ / peptidoglycan biosynthetic process / carboxypeptidase activity / cell wall organization / regulation of cell shape / endopeptidase activity / periplasmic space / cell division / response to antibiotic / serine-type endopeptidase activity / proteolysis / plasma membrane類似検索 - 分子機能 D-Ala-D-Ala carboxypeptidase C, peptidase S13 / Peptidase S13, D-Ala-D-Ala carboxypeptidase C / D-Ala-D-Ala carboxypeptidase 3 (S13) family / D-tyrosyl-trna(Tyr) Deacylase; Chain: A; / Beta-lactamase / DD-peptidase/beta-lactamase superfamily / 3-Layer(bba) Sandwich / Beta-lactamase/transpeptidase-like / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 Chem-35P / D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase DacB類似検索 - 構成要素 |
---|
生物種 | Escherichia coli (大腸菌) |
---|
手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.65 Å |
---|
データ登録者 | Kishida, H. / Unzai, S. / Roper, D.I. / Lloyd, A. / Park, S.-Y. / Tame, J.R.H. |
---|
引用 | ジャーナル: Biochemistry / 年: 2006 タイトル: Crystal structure of penicillin binding protein 4 (dacB) from Escherichia coli, both in the native form and covalently linked to various antibiotics 著者: Kishida, H. / Unzai, S. / Roper, D.I. / Lloyd, A. / Park, S.-Y. / Tame, J.R.H. |
---|
履歴 | 登録 | 2005年11月8日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: PDBJ |
---|
改定 1.0 | 2006年6月13日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
---|
改定 1.1 | 2008年5月1日 | Group: Version format compliance |
---|
改定 1.2 | 2011年7月13日 | Group: Non-polymer description / Version format compliance |
---|
改定 1.3 | 2016年10月19日 | Group: Database references / Non-polymer description |
---|
|
---|