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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2eql | ||||||
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タイトル | CRYSTALLOGRAPHIC STUDIES OF A CALCIUM BINDING LYSOZYME FROM EQUINE MILK AT 2.5 ANGSTROMS RESOLUTION | ||||||
![]() | HORSE MILK LYSOZYME | ||||||
![]() | HYDROLASE(O-GLYCOSYL) | ||||||
機能・相同性 | ![]() cytolysis / metabolic process / lysozyme / lysozyme activity / defense response to bacterium / metal ion binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Tsuge, H. / Ago, H. / Miyano, M. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Crystallographic studies of a calcium binding lysozyme from equine milk at 2.5 A resolution. 著者: Tsuge, H. / Ago, H. / Noma, M. / Nitta, K. / Sugai, S. / Miyano, M. #1: ![]() タイトル: A Structural Study of Calcium-Binding Equine Lysozyme by Two-Dimensional 1H-NMR 著者: Tsuge, H. / Koseki, K. / Miyano, M. / Shimazaki, K. / Chuman, T. / Matsumoto, T. / Noma, M. / Nitta, K. / Sugai, S. #2: ![]() タイトル: Calcium-Binding Lysozymes 著者: Nitta, K. / Tsuge, H. / Shimazaki, K. / Sugai, S. #3: ![]() タイトル: The Calcium-Binding Property of Equine Lysozyme 著者: Nitta, K. / Tsuge, H. / Sugai, S. / Shimazaki, K. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 31.9 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 25.2 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 411.5 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 420 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 7.9 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 9.5 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 14673.627 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.04 Å3/Da / 溶媒含有率: 39.71 % | ||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS pH: 5.6 / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 | ||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
反射 | *PLUS 最高解像度: 2.3 Å / Num. obs: 4842 / Rmerge(I) obs: 0.039 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2.5→7 Å / σ(F): 3 /
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.5→7 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS Rfactor obs: 0.234 / Rfactor Rwork: 0.234 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS タイプ: x_angle_d / Dev ideal: 4.08 |