登録情報 | データベース: PDB / ID: 2ebh |
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タイトル | Crystal structures reveal a thiol-protease like catalytic triad in the C-terminal region of Pasteurella multocida toxin |
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要素 | Dermonecrotic toxin |
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キーワード | TOXIN / Pasteurella multocida toxin / Cys1165Ser mutant / inactivated mutant |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
symbiont-mediated perturbation of host G protein-coupled receptor signal transduction pathway / symbiont-mediated killing of host cell / phospholipase activity / phospholipid binding / toxin activity / host cell plasma membrane / extracellular region / membrane / cytoplasm類似検索 - 分子機能 Butyryl-CoA Dehydrogenase, subunit A; domain 3 - #180 / Rossmann fold - #11550 / : / Pasteurella multocida toxin, C3 domain / Secreted effector protein ssei fold / Secreted effector protein ssei. / : / Pasteurella multocida toxin, C2 domain / Domain of unknown function DUF6543 / Dermonecrotic toxin, N-terminal domain ...Butyryl-CoA Dehydrogenase, subunit A; domain 3 - #180 / Rossmann fold - #11550 / : / Pasteurella multocida toxin, C3 domain / Secreted effector protein ssei fold / Secreted effector protein ssei. / : / Pasteurella multocida toxin, C2 domain / Domain of unknown function DUF6543 / Dermonecrotic toxin, N-terminal domain / Dermonecrotic/RTX toxin, membrane localization domain / Membrane Localization Domain / Butyryl-CoA Dehydrogenase, subunit A; domain 3 / Papain-like cysteine peptidase superfamily / Roll / Up-down Bundle / Rossmann fold / 3-Layer(aba) Sandwich / Mainly Alpha / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 |
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生物種 | Pasteurella multocida (バクテリア) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.4 Å |
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データ登録者 | Kitadokoro, K. / Horiguchi, Y. / Kamitani, S. |
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引用 | ジャーナル: Proc.Natl.Acad.Sci.Usa / 年: 2007 タイトル: Crystal structures reveal a thiol protease-like catalytic triad in the C-terminal region of Pasteurella multocida toxin 著者: Kitadokoro, K. / Kamitani, S. / Miyazawa, M. / Hanajima-Ozawa, M. / Fukui, A. / Miyake, M. / Horiguchi, Y. |
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履歴 | 登録 | 2007年2月8日 | 登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2007年3月6日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2008年4月30日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2011年7月13日 | Group: Version format compliance |
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改定 2.0 | 2020年7月29日 | Group: Atomic model / Data collection ...Atomic model / Data collection / Database references / Derived calculations / Non-polymer description / Structure summary カテゴリ: atom_site / chem_comp ...atom_site / chem_comp / entity / entity_name_com / pdbx_branch_scheme / pdbx_chem_comp_identifier / pdbx_entity_branch / pdbx_entity_branch_descriptor / pdbx_entity_branch_link / pdbx_entity_branch_list / pdbx_entity_nonpoly / pdbx_molecule_features / pdbx_nonpoly_scheme / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site / struct_site_gen Item: _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x ..._atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x / _atom_site.Cartn_y / _atom_site.Cartn_z / _atom_site.auth_asym_id / _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.auth_comp_id / _atom_site.auth_seq_id / _atom_site.label_atom_id / _atom_site.label_comp_id / _atom_site.type_symbol / _chem_comp.formula / _chem_comp.formula_weight / _chem_comp.id / _chem_comp.mon_nstd_flag / _chem_comp.name / _chem_comp.pdbx_synonyms / _chem_comp.type / _entity.formula_weight / _entity.pdbx_description / _entity.src_method / _entity.type / _struct_ref_seq_dif.details 解説: Carbohydrate remediation / Provider: repository / タイプ: Remediation |
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改定 2.1 | 2021年11月10日 | Group: Database references / Structure summary / カテゴリ: chem_comp / database_2 / struct_ref_seq_dif Item: _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI ..._chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ref_seq_dif.details |
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改定 2.2 | 2023年10月25日 | Group: Data collection / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_initial_refinement_model |
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