登録情報 | データベース: PDB / ID: 2e3c |
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タイトル | Crystal structure of the catalytic domain of pyrrolysyl-tRNA synthetase |
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要素 | Pyrrolysyl-tRNA synthetase |
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キーワード | LIGASE / aminoacyl-tRNA synthetase / tRNA / pyrrolysine / translation / Structural Genomics / NPPSFA / National Project on Protein Structural and Functional Analyses / RIKEN Structural Genomics/Proteomics Initiative / RSGI |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
pyrrolysine-tRNAPyl ligase / pyrrolysyl-tRNA synthetase activity / tRNA aminoacylation for protein translation / tRNA binding / ATP binding / cytoplasm類似検索 - 分子機能 Pyrrolysyl-tRNA ligase / Pyrrolysyl-tRNA ligase, N-terminal / Helix hairpin bin / Pyrrolysyl-tRNA ligase, C-terminal / Phenylalanyl-tRNA synthetase / tRNA synthetases class II core domain (F) / Bira Bifunctional Protein; Domain 2 / BirA Bifunctional Protein; domain 2 / Aminoacyl-tRNA synthetase, class II / Aminoacyl-transfer RNA synthetases class-II family profile. ...Pyrrolysyl-tRNA ligase / Pyrrolysyl-tRNA ligase, N-terminal / Helix hairpin bin / Pyrrolysyl-tRNA ligase, C-terminal / Phenylalanyl-tRNA synthetase / tRNA synthetases class II core domain (F) / Bira Bifunctional Protein; Domain 2 / BirA Bifunctional Protein; domain 2 / Aminoacyl-tRNA synthetase, class II / Aminoacyl-transfer RNA synthetases class-II family profile. / Class II Aminoacyl-tRNA synthetase/Biotinyl protein ligase (BPL) and lipoyl protein ligase (LPL) / Helix Hairpins / 2-Layer Sandwich / Orthogonal Bundle / Mainly Alpha / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 |
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生物種 | Methanosarcina mazei (古細菌) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.65 Å |
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データ登録者 | Yanagisawa, T. / Ishii, R. / Yokoyama, S. / RIKEN Structural Genomics/Proteomics Initiative (RSGI) |
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引用 | ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 2008 タイトル: Crystallographic Studies on Multiple Conformational States of Active-site Loops in Pyrrolysyl-tRNA Synthetase 著者: Yanagisawa, T. / Ishii, R. / Fukunaga, R. / Kobayashi, T. / Sakamoto, K. / Yokoyama, S. |
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履歴 | 登録 | 2006年11月22日 | 登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2007年12月11日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2011年7月13日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2023年10月25日 | Group: Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_ref_seq_dif Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ref_seq_dif.details |
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