登録情報 | データベース: PDB / ID: 2dh5 |
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タイトル | Crystal structure of E. coli Holo-TrpB |
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要素 | tryptophan synthase beta subunit |
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キーワード | LYASE / Tryptophan synthase / beta-chain / PLP / Structural Genomics / NPPSFA / National Project on Protein Structural and Functional Analyses / RIKEN Structural Genomics/Proteomics Initiative / RSGI |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
tryptophan synthase / tryptophan synthase activity / tryptophan biosynthetic process / aromatic amino acid family biosynthetic process / pyridoxal phosphate binding / protein homodimerization activity / identical protein binding / cytoplasm / cytosol類似検索 - 分子機能 Tryptophan synthase, beta chain, conserved site / Tryptophan synthase, beta chain / Tryptophan synthase beta chain/beta chain-like / Tryptophan synthase beta chain pyridoxal-phosphate attachment site. / Rossmann fold - #1100 / Pyridoxal-phosphate dependent enzyme / Tryptophan synthase beta subunit-like PLP-dependent enzyme / Pyridoxal-phosphate dependent enzyme / Rossmann fold / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 PYRIDOXAL-5'-PHOSPHATE / Tryptophan synthase beta chain類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Escherichia coli (大腸菌) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.9 Å |
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データ登録者 | Nishio, K. / Morimoto, Y. / Ogasahara, K. / Yutani, K. / Tsukihara, T. / RIKEN Structural Genomics/Proteomics Initiative (RSGI) |
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引用 | ジャーナル: Febs J. / 年: 2010 タイトル: Large conformational changes in the Escherichia coli tryptophan synthase beta(2) subunit upon pyridoxal 5'-phosphate binding 著者: Nishio, K. / Ogasahara, K. / Morimoto, Y. / Tsukihara, T. / Lee, S.J. / Yutani, K. |
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履歴 | 登録 | 2006年3月23日 | 登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2007年4月24日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2007年10月4日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2011年7月13日 | Group: Non-polymer description / Version format compliance |
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改定 1.3 | 2023年10月25日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_conn / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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