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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2b2h | ||||||
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タイトル | Ammonium Transporter Amt-1 from A. fulgidus (AS) | ||||||
![]() | ammonium transporter | ||||||
![]() | TRANSPORT PROTEIN / MEMBRANE PROTEIN / TRANSPORTER | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||
![]() | Andrade, S.L.A. / Dickmanns, A. / Ficner, R. / Einsle, O. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Crystal structure of the archaeal ammonium transporter Amt-1 from Archaeoglobus fulgidus 著者: Andrade, S.L. / Dickmanns, A. / Ficner, R. / Einsle, O. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 86.6 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 64.8 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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単位格子 |
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Components on special symmetry positions |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 42086.070 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() |
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#2: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 3.97 Å3/Da / 溶媒含有率: 69 % |
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結晶化 | 温度: 298 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 8.5 詳細: PEG 400, Tris/HCl, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() |
検出器 | タイプ: MARRESEARCH / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 2005年5月13日 |
放射 | モノクロメーター: RIGAKU MIRRORS / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 1.54→100 Å / Num. all: 93633 / Num. obs: 92426 / % possible obs: 98.7 % / Observed criterion σ(F): 2 / Observed criterion σ(I): 2 |
反射 シェル | 解像度: 1.54→1.64 Å / % possible all: 93.3 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 開始モデル: PDB ENTRY 2B2F 解像度: 1.54→100 Å / σ(F): 2 / 立体化学のターゲット値: Engh & Huber 詳細: THIS IS A TWINNED STRUCTURE. THE TWINNING OPERATOR IS (H,K,L) -> (H,-H-K,-L) AND THE TWINNING FRACTION IS 0.238. THE R-FACTOR IS 0.154 AND THE R-FREE IS 0.169 WHEN THIS TWINNING OPERATOR IS USED.
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.54→100 Å
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拘束条件 |
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