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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 240d | ||||||||||||||||||
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タイトル | EFFECT OF END BASE STEPS ON DNA FORM: CRYSTAL STRUCTURE OF THE A-DNA DECAMER D(CCGGGCCCGG) | ||||||||||||||||||
要素 | DNA (5'-D(*キーワード | DNA / A-DNA / DOUBLE HELIX / DEOXYRIBONUCLEIC ACID | 機能・相同性 | DNA | 機能・相同性情報 手法 | X線回折 / 解像度: 2 Å | データ登録者 | Champion, D. / Kumar, C.S. / Ramakrishnan, B. / Gautham, N. / Viswamitra, M.A. | 引用 | ジャーナル: To be Published | タイトル: Effect of End Base Steps on DNA Form: Crystal Structure of the A-DNA Decamer d(CCGGGCCCGG) 著者: Champion, D. / Kumar, C.S. / Ramakrishnan, B. / Gautham, N. / Viswamitra, M.A. 履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 240d.cif.gz | 20.4 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb240d.ent.gz | 13.6 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 240d.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 240d_validation.pdf.gz | 323.6 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 240d_full_validation.pdf.gz | 331.8 KB | 表示 | |
XML形式データ | 240d_validation.xml.gz | 2.1 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 240d_validation.cif.gz | 3.2 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/40/240d ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/40/240d | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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単位格子 |
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-要素
#1: DNA鎖 | 分子量: 3046.980 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 #2: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1 |
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-試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.3 Å3/Da / 溶媒含有率: 46.47 % |
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-データ収集
放射光源 | 由来: SEALED TUBE / タイプ: OTHER / 波長: 1.5418 |
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検出器 | タイプ: ENRAF-NONIUS / 検出器: DIFFRACTOMETER / 日付: 1991年3月1日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | 最高解像度: 2 Å / Num. obs: 1591 / Observed criterion σ(I): 3 |
-解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2→8 Å / σ(F): 3 /
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原子変位パラメータ | Biso mean: 30.03 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2→8 Å
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拘束条件 |
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