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Open data
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Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 1zxu | ||||||
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Title | X-ray structure of protein from arabidopsis thaliana AT5G01750 | ||||||
![]() | At5g01750 protein | ||||||
![]() | STRUCTURAL GENOMICS / UNKNOWN FUNCTION / AT5G01750 / PFAM PF01167 / TULP / PROTEIN STRUCTURE INITIATIVE / PSI / CENTER FOR EUKARYOTIC STRUCTURAL GENOMICS / CESG | ||||||
Function / homology | ![]() | ||||||
Biological species | ![]() ![]() | ||||||
Method | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Wesenberg, G.E. / Phillips Jr., G.N. / Bitto, E. / Bingman, C.A. / Allard, S.T.M. / Center for Eukaryotic Structural Genomics (CESG) | ||||||
![]() | ![]() Title: X-ray structure of protein from arabidopsis thaliana AT5G01750 Authors: Center for Eukaryotic Structural Genomics (CESG) | ||||||
History |
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Structure visualization
Structure viewer | Molecule: ![]() ![]() |
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Downloads & links
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Download
PDBx/mmCIF format | ![]() | 48.6 KB | Display | ![]() |
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PDB format | ![]() | 34.3 KB | Display | ![]() |
PDBx/mmJSON format | ![]() | Tree view | ![]() | |
Others | ![]() |
-Validation report
Summary document | ![]() | 442.2 KB | Display | ![]() |
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Full document | ![]() | 443.3 KB | Display | |
Data in XML | ![]() | 9.8 KB | Display | |
Data in CIF | ![]() | 13.2 KB | Display | |
Arichive directory | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-Related structure data
Similar structure data | |
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Other databases |
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Links
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Assembly
Deposited unit | ![]()
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1 |
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Unit cell |
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Components
#1: Protein | Mass: 24702.094 Da / Num. of mol.: 1 Source method: isolated from a genetically manipulated source Source: (gene. exp.) ![]() ![]() ![]() ![]() |
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#2: Chemical | ChemComp-EDO / |
#3: Water | ChemComp-HOH / |
-Experimental details
-Experiment
Experiment | Method: ![]() |
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Sample preparation
Crystal | Density Matthews: 2.5 Å3/Da / Density % sol: 50.2 % |
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Crystal grow | Temperature: 293 K / Method: batch seeding / pH: 5.5 Details: 10 MG/ML PROTEIN, 25% PEG 3350, 0.2 M AMMONIUM ACETATE, 0.1 M BISTRIS, temperature 293K, pH 5.5, BATCH SEEDING |
-Data collection
Diffraction |
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Diffraction source | Source: ![]() ![]() ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Detector | Type: ADSC / Detector: CCD / Date: May 25, 2005 Details: HORIZONTAL SAGITALLY FOCUSING 2ND BENT MONOCHROMATOR CRYSTAL, VERTICAL BENT FOCUSING MIRROR | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Radiation | Monochromator: CRYOGENICALLY COOLED SI (111) DOUBLE BOUNCE / Protocol: MAD / Monochromatic (M) / Laue (L): M / Scattering type: x-ray | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Radiation wavelength |
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Reflection | D res high: 1.7 Å / D res low: 50 Å
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Diffraction reflection shell |
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Reflection | Resolution: 1.7→50 Å / Num. obs: 20314 / % possible obs: 100 % / Redundancy: 13.6 % / Rmerge(I) obs: 0.08 / Χ2: 1.535 / Net I/σ(I): 18.016 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Reflection shell |
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-Phasing
Phasing | Method: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Phasing MAD set | Highest resolution: 1.7 Å / Lowest resolution: 14.62 Å
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Phasing MAD set shell |
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