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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1z94 | ||||||
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タイトル | X-Ray Crystal Structure of Protein CV1439 from Chromobacterium violaceum. Northeast Structural Genomics Consortium Target CvR12. | ||||||
![]() | conserved hypothetical protein | ||||||
![]() | STRUCTURAL GENOMICS / UNKNOWN FUNCTION / hypothetical protein / NESG / CV1439 / PSI / Protein Structure Initiative / Northeast Structural Genomics Consortium | ||||||
機能・相同性 | Activator of Hsp90 ATPase homologue 1-like / Activator of Hsp90 ATPase homolog 1-like protein / START domain / Alpha-D-Glucose-1,6-Bisphosphate; Chain A, domain 4 / START-like domain superfamily / 2-Layer Sandwich / Alpha Beta / Uncharacterized protein![]() | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Kuzin, A. / Vorobiev, S.M. / Yong, W. / Forouhar, F. / Xio, R. / Ma, L.-C. / Acton, T. / Montelione, G.T. / Tong, L. / Hunt, J.F. / Northeast Structural Genomics Consortium (NESG) | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Crystal Structure of the Hypothetical Protein CV1439 from Chromobacterium violaceum. Northeast Structural Genomics Consortium Target CVR12. 著者: Kuzin, A. / Vorobiev, S.M. / Yong, W. / Forouhar, F. / Xio, R. / Ma, L.-C. / Acton, T. / Montelione, G.T. / Tong, L. / Hunt, J.F. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 175.1 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 148.5 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 469.1 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 491.1 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 37.8 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 53.5 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
類似構造データ | |
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その他のデータベース |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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2 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 16336.344 Da / 分子数: 6 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 株: ATCC 12472 / 遺伝子: CV1439 / 発現宿主: ![]() ![]() #2: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.92 Å3/Da / 溶媒含有率: 57.93 % |
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結晶化 | 温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 4.6 詳細: 2 M Sodium chloride, 0.1 M sodium acetate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: ADSC QUANTUM 4 / 検出器: CCD / 日付: 2005年3月19日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 0.97916 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.1→30 Å / Num. obs: 129114 / % possible obs: 99.4 % / Observed criterion σ(F): 0 / Observed criterion σ(I): 0 / 冗長度: 6.5 % / Biso Wilson estimate: 20.6 Å2 / Rmerge(I) obs: 0.051 |
反射 シェル | 解像度: 2.1→2.18 Å / 冗長度: 6.5 % / Rmerge(I) obs: 0.301 / Num. unique all: 12978 / % possible all: 100 |
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解析
ソフトウェア | 名称: CNS / バージョン: 1.1 / 分類: 精密化 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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精密化 | 構造決定の手法: ![]()
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溶媒の処理 | 溶媒モデル: FLAT MODEL / Bsol: 55.467 Å2 / ksol: 0.35906 e/Å3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | Biso mean: 37.8 Å2
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Refine analyze |
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.1→26.75 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル | 解像度: 2.1→2.23 Å / Rfactor Rfree error: 0.007 / Total num. of bins used: 6
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Xplor file |
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