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Yorodumi- PDB-1yce: Structure of the rotor ring of F-type Na+-ATPase from Ilyobacter ... -
+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 1yce | ||||||
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Title | Structure of the rotor ring of F-type Na+-ATPase from Ilyobacter tartaricus | ||||||
Components | subunit c | ||||||
Keywords | MEMBRANE PROTEIN / ATP Synthase / Na binding site | ||||||
Function / homology | Function and homology information sodium ion transport / proton-transporting ATP synthase complex, coupling factor F(o) / proton-transporting ATP synthase activity, rotational mechanism / lipid binding / plasma membrane Similarity search - Function | ||||||
Biological species | Ilyobacter tartaricus (bacteria) | ||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / Resolution: 2.4 Å | ||||||
Authors | Meier, T. / Polzer, P. / Diederichs, K. / Welte, W. / Dimroth, P. | ||||||
Citation | Journal: Science / Year: 2005 Title: Structure of the rotor ring of F-Type Na+-ATPase from Ilyobacter tartaricus. Authors: Meier, T. / Polzer, P. / Diederichs, K. / Welte, W. / Dimroth, P. | ||||||
History |
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Remark 600 | HETEROGEN THE AUTHORS HAD ZWITTERGENT 3-12 IN THE CRYSTALLIZATION DROP BUT AS THIS IS MUCH BIGGER ...HETEROGEN THE AUTHORS HAD ZWITTERGENT 3-12 IN THE CRYSTALLIZATION DROP BUT AS THIS IS MUCH BIGGER THAN THE DENSITY, THE AUTHORS CALLED IT F09, NONAN-1-OL, BECAUSE IT EXACTLY MATCHES THE DENSITY. THE AUTHORS STATE THAT IF THE DENSITY COMES FROM ZWITTERGENT 3-12, THEN THE REST OF IT SEEMS TO BE DISORDERED. | ||||||
Remark 650 | HELIX AUTHOR DETERMINED HELIX RECORDS |
-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
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-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 1yce.cif.gz | 664.5 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
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PDB format | pdb1yce.ent.gz | 556.3 KB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 1yce.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Summary document | 1yce_validation.pdf.gz | 728.7 KB | Display | wwPDB validaton report |
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Full document | 1yce_full_validation.pdf.gz | 767.7 KB | Display | |
Data in XML | 1yce_validation.xml.gz | 114.7 KB | Display | |
Data in CIF | 1yce_validation.cif.gz | 172.9 KB | Display | |
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/yc/1yce ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/yc/1yce | HTTPS FTP |
-Related structure data
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-Links
-Assembly
Deposited unit |
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Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
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