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Open data
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Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 1y9k | ||||||
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Title | IAA acetyltransferase from Bacillus cereus ATCC 14579 | ||||||
![]() | IAA acetyltransferase | ||||||
![]() | TRANSFERASE / structural genomics / Midwest Center for Structural Genomics (MCSG) / Bacillus cereus ATCC 14579 / IAA acetyltransferase / acetyltransferase / PSI / Protein Structure Initiative | ||||||
Function / homology | ![]() N-acetyltransferase activity / Transferases; Acyltransferases; Transferring groups other than aminoacyl groups Similarity search - Function | ||||||
Biological species | ![]() ![]() | ||||||
Method | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Nocek, B.P. / Osipiuk, J. / Li, H. / Collart, F. / Joachimiak, A. / Midwest Center for Structural Genomics (MCSG) | ||||||
![]() | ![]() Title: A crystal structure of IAA acetyltransferase from Bacillus cereus Authors: Nocek, B.P. / Osipiuk, J. / Li, H. / Collart, F. / Joachimiak, A. | ||||||
History |
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Structure visualization
Structure viewer | Molecule: ![]() ![]() |
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Downloads & links
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Download
PDBx/mmCIF format | ![]() | 130.9 KB | Display | ![]() |
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PDB format | ![]() | 110.4 KB | Display | ![]() |
PDBx/mmJSON format | ![]() | Tree view | ![]() | |
Others | ![]() |
-Validation report
Summary document | ![]() | 451 KB | Display | ![]() |
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Full document | ![]() | 458.5 KB | Display | |
Data in XML | ![]() | 25.9 KB | Display | |
Data in CIF | ![]() | 37.1 KB | Display | |
Arichive directory | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-Related structure data
Similar structure data | |
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Other databases |
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Links
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Assembly
Deposited unit | ![]()
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1 | ![]()
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2 | ![]()
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3 | ![]()
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4 | ![]()
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Unit cell |
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Components
#1: Protein | Mass: 17797.801 Da / Num. of mol.: 4 Source method: isolated from a genetically manipulated source Source: (gene. exp.) ![]() ![]() ![]() ![]() References: UniProt: Q81FK8, Transferases; Acyltransferases; Transferring groups other than aminoacyl groups #2: Water | ChemComp-HOH / | |
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-Experimental details
-Experiment
Experiment | Method: ![]() |
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Sample preparation
Crystal | Density Matthews: 3.61 Å3/Da / Density % sol: 65.65 % |
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Crystal grow | Temperature: 289 K / Method: vapor diffusion, sitting drop / pH: 9 Details: 2.0 M Ammonium sulfate, CAPS pH 10.5 0.1 Lithium Sulfate, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 289K |
-Data collection
Diffraction | Mean temperature: 150 K |
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Diffraction source | Source: ![]() ![]() ![]() |
Detector | Type: SBC-2 / Detector: CCD / Date: Jul 15, 2004 |
Radiation | Monochromator: Double Crystal / Protocol: SINGLE WAVELENGTH / Monochromatic (M) / Laue (L): M / Scattering type: x-ray |
Radiation wavelength | Wavelength: 0.97945 Å / Relative weight: 1 |
Reflection | Resolution: 2.39→30.4 Å / Num. all: 37886 / Num. obs: 37374 / % possible obs: 99.5 % / Observed criterion σ(F): 2 / Observed criterion σ(I): 2 / Rsym value: 0.115 / Net I/σ(I): 19.85 |
Reflection shell | Resolution: 2.39→2.39 Å / % possible all: 94.5 |
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Processing
Software |
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Refinement | Method to determine structure: ![]()
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Solvent computation | Ion probe radii: 0.8 Å / Shrinkage radii: 0.8 Å / VDW probe radii: 1.2 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Displacement parameters | Biso mean: 39.246 Å2
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Refinement step | Cycle: LAST / Resolution: 2.39→30.4 Å
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Refine LS restraints |
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LS refinement shell | Resolution: 2.39→2.39 Å / Total num. of bins used: 20
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Refinement TLS params. | Method: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION
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Refinement TLS group |
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