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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1xnd | ||||||
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タイトル | HIGH-RESOLUTION STRUCTURES OF XYLANASES FROM B. CIRCULANS AND T. HARZIANUM IDENTIFY A NEW FOLDING PATTERN AND IMPLICATIONS FOR THE ATOMIC BASIS OF THE CATALYSIS | ||||||
![]() | XYLANASE | ||||||
![]() | GLYCOSIDASE | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Campbell, R.L. / Rose, D.R. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: High-Resolution Structures of Xylanases from B. Circulans and T. Harzianum Identify a New Folding Pattern and Implications for the Atomic Basis of the Catalysis 著者: Campbell, R.L. / Rose, D.R. / Wakarchuk, W.W. / To, R.J. / Sung, W. / Yaguchi, M. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 48.8 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 34.7 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 362.1 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 371.4 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 6.3 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 9 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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Atom site foot note | 1: CIS PROLINE - PRO 53 / 2: CIS PROLINE - PRO 83 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 20717.320 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() |
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#2: 水 | ChemComp-HOH / |
配列の詳細 | THE SEQUENCE WAS REPORTED IN: YAGUCHI, M., ROY, C., WATSON, D. C., ROLLIN, F., TAN, L. U. SENIOR, D. ...THE SEQUENCE WAS REPORTED IN: YAGUCHI, M., ROY, C., WATSON, D. C., ROLLIN, F., TAN, L. U. SENIOR, D. J., AND SADDLER, J. N. (1992). THE AMINO ACID SE OF THE 20 KD XYLANASE FROM TRICHODERM |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.57 Å3/Da / 溶媒含有率: 52.15 % |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2→8 Å / σ(F): 2 詳細: ALL NON-GLYCINE RESIDUES LIE WITHIN THE ALLOWED REGIONS OF A RAMACHANDRAN PLOT EXCEPT THR 2, ASN 11, ASP 170 AND SER 181. THE ELECTRON DENSITY FOR THR 2 AND ASN 11 IS WEAK AND SOMEWHAT ...詳細: ALL NON-GLYCINE RESIDUES LIE WITHIN THE ALLOWED REGIONS OF A RAMACHANDRAN PLOT EXCEPT THR 2, ASN 11, ASP 170 AND SER 181. THE ELECTRON DENSITY FOR THR 2 AND ASN 11 IS WEAK AND SOMEWHAT AMBIGUOUS, WHILE THE DENSITY FOR BOTH ASP 121 AND ALA 165 IS VERY CLEAR.
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2→8 Å
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拘束条件 |
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