#1: ジャーナル: Acta Crystallogr.,Sect.D / 年: 2001 タイトル: Crystallization and preliminary X-ray diffraction studies of a novel alkaline serine protease (KP-43) from alkaliphilic Bacillus sp. strain KSM-KP43 著者: Nonaka, T. / Fujihashi, M. / Kita, A. / Saeki, K. / Ito, S. / Miki, K.
履歴
登録
2004年7月8日
登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ
改定 1.0
2004年9月14日
Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1
2008年4月30日
Group: Version format compliance
改定 1.2
2011年7月13日
Group: Source and taxonomy / Version format compliance
モノクロメーター: double crystal monochromator / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長
波長: 1 Å / 相対比: 1
反射
解像度: 1.73→20 Å / Num. obs: 40078 / % possible obs: 96.4 % / 冗長度: 5.761 % / Rmerge(I) obs: 0.057 / Net I/σ(I): 21.98
反射 シェル
解像度: 1.73→1.79 Å / Rmerge(I) obs: 0.204 / Mean I/σ(I) obs: 6.086 / % possible all: 86.6
-
解析
ソフトウェア
名称
分類
HKL-2000
データ収集
SHELX
モデル構築
SHELXL-97
精密化
HKL-2000
データ削減
SCALEPACK
データスケーリング
CNS
位相決定
精密化
構造決定の手法: フーリエ合成 / 解像度: 1.73→20 Å / Num. parameters: 31936 / Num. restraintsaints: 39701 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / 立体化学のターゲット値: Engh & Huber 詳細: Water molecules from HOH 3306 to 3309 are related to multi-conformational ASN A 1.
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.2116
2012
-
RANDOM
obs
0.142
38006
90.8 %
-
all
-
40018
-
-
Refine analyze
Num. disordered residues: 7 / Occupancy sum hydrogen: 0 / Occupancy sum non hydrogen: 3513.94