+データを開く
-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1w7d | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
タイトル | NMR Structure of Fasciclin-Like Protein From Rhodobacter sphaeroides | ||||||
要素 | BETA-IG-H3/FASCICLIN | ||||||
キーワード | CELL ADHESION (細胞接着) / FASCICLIN | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 FAS1 domain / FAS1 domain / FAS1 domain / FAS1 domain superfamily / Fasciclin domain / FAS1/BIgH3 domain profile. / Four repeated domains in the Fasciclin I family of proteins, present in many other contexts. / Roll / Mainly Beta 類似検索 - ドメイン・相同性 | ||||||
生物種 | RHODOBACTER SPHAEROIDES (バクテリア) | ||||||
手法 | 溶液NMR | ||||||
Model type details | MINIMIZED AVERAGE | ||||||
データ登録者 | Moody, R. / Phillips-Jones, M.K. / Williamson, M.P. | ||||||
引用 | ジャーナル: FEBS Open Bio / 年: 2013 タイトル: Structure and Function of a Bacterial Fasciclin I Domain Protein Elucidates Function of Related Cell Adhesion Proteins Such as Tgfbip and Periostin. 著者: Moody, R.G. / Williamson, M.P. | ||||||
履歴 |
| ||||||
Remark 650 | HELIX DETERMINATION METHOD: AUTHOR PROVIDED. | ||||||
Remark 700 | SHEET DETERMINATION METHOD: AUTHOR PROVIDED. |
-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
---|
-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1w7d.cif.gz | 45.3 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
---|---|---|---|---|
PDB形式 | pdb1w7d.ent.gz | 34.6 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1w7d.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/w7/1w7d ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/w7/1w7d | HTTPS FTP |
---|
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
| |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 |
| |||||||||
NMR アンサンブル |
|
-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 13848.373 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) RHODOBACTER SPHAEROIDES (バクテリア) 発現宿主: ESCHERICHIA COLI (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21(DE3) / 参照: UniProt: Q3IXZ6 |
---|---|
配列の詳細 | RHODOBACTE |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NMR実験 |
| ||||||||||||
NMR実験の詳細 | Text: NONE |
-試料調製
詳細 | 内容: 90% WATER/10% D2O, 50MM NAPHOS |
---|---|
試料状態 | イオン強度: 50 mM / pH: 7.0 / 圧: 1.0 atm / 温度: 298.0 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker DMX / 製造業者: Bruker / モデル: DMX / 磁場強度: 800 MHz |
---|
-解析
NMR software |
| ||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
精密化 | ソフトェア番号: 1 / 詳細: WATER REFINEMENT | ||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: BEST WATER REFINED STRUCTURE 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 1 |