登録情報 データベース : PDB / ID : 1vc9 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Crystal Structure of a T.thermophilus HB8 Ap6A hydrolase E50Q mutant-Mg2+-ATP complex 要素Ndx1 詳細 キーワード HYDROLASE / Nudix protein / diadenosine polyphosphate / Ap6A / Thermus thermophilus HB8 / RIKEN Structural Genomics/Proteomics Initiative / RSGI / Structural Genomics機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
AMP biosynthetic process / bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase (asymmetrical) activity / diadenosine hexaphosphate hydrolase (ATP-forming) / ATP biosynthetic process / hydrolase activity, acting on acid anhydrides, in phosphorus-containing anhydrides / ATP binding / metal ion binding 類似検索 - 分子機能 NUDIX hydrolase / NUDIX hydrolase, conserved site / Nudix box signature. / Nucleoside Triphosphate Pyrophosphohydrolase / Nucleoside Triphosphate Pyrophosphohydrolase / NUDIX domain / Nudix hydrolase domain profile. / NUDIX hydrolase domain / NUDIX hydrolase-like domain superfamily / Alpha-Beta Complex / Alpha Beta 類似検索 - ドメイン・相同性 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / Diadenosine hexaphosphate hydrolase 類似検索 - 構成要素生物種 Thermus thermophilus (バクテリア)手法 X線回折 / 多波長異常分散 / 解像度 : 2.3 Å 詳細データ登録者 Iwai, T. / Nakagawa, N. / Kuramitsu, S. / Masui, R. / RIKEN Structural Genomics/Proteomics Initiative (RSGI) 引用ジャーナル : To be Published タイトル : Crystal Structure of Nudix Protein Ndx1 from Thermus thermophilus HB8 in binary complex with diadenosine hexaphosphate著者 : Iwai, T. / Nakagawa, N. / Kuramitsu, S. / Masui, R. 履歴 登録 2004年3月5日 登録サイト : PDBJ / 処理サイト : PDBJ改定 1.0 2005年4月26日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2008年4月27日 Group : Version format compliance改定 1.2 2011年7月13日 Group : Source and taxonomy / Version format compliance改定 1.3 2021年11月10日 Group : Database references / Derived calculationsカテゴリ : database_2 / pdbx_struct_conn_angle ... database_2 / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item : _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ... _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id 改定 1.4 2023年12月27日 Group : Data collection / カテゴリ : chem_comp_atom / chem_comp_bond
すべて表示 表示を減らす