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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1urr | ||||||
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タイトル | A novel Drosophila Melanogaster Acylphosphatase (AcPDro2) | ||||||
![]() | CG18505 PROTEIN | ||||||
![]() | HYDROLASE / ACYLPHOSPHATASE / ENZYME | ||||||
機能・相同性 | ![]() cellular metabolic process / acylphosphatase / acylphosphatase activity / hydrolase activity / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Rosano, C. / Zuccotti, S. / Bolognesi, M. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Three-Dimensional Structural Characterization of a Novel Drosophila Melanogaster Acylphosphatase 著者: Zuccotti, S. / Rosano, C. / Ramazzotti, M. / Degl'Innocenti, D. / Stefani, M. / Manao, G. / Bolognesi, M. #1: ジャーナル: FEBS Lett. / 年: 2003 タイトル: Characterization of a Novel Drosophila Melanogaster Acylphosphatase 著者: Degl'Innocenti, D. / Ramazzotti, M. / Marzocchini, R. / Chiti, F. / Raugei, G. | ||||||
履歴 |
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Remark 700 | SHEET THE SHEET STRUCTURE OF THIS MOLECULE IS BIFURCATED. IN ORDER TO REPRESENT THIS FEATURE IN ... SHEET THE SHEET STRUCTURE OF THIS MOLECULE IS BIFURCATED. IN ORDER TO REPRESENT THIS FEATURE IN THE SHEET RECORDS BELOW, TWO SHEETS ARE DEFINED. |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 58.7 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 42.7 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 2acyS S: 精密化の開始モデル |
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類似構造データ |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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Components on special symmetry positions |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 11783.540 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 発現宿主: ![]() ![]() |
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#2: 化合物 | ChemComp-GOL / |
#3: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.52 Å3/Da / 溶媒含有率: 55.2 % |
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結晶化 | pH: 4.5 / 詳細: pH 4.50 |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 0.933 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 1.5→39.5 Å / Num. obs: 19859 / % possible obs: 98.7 % / Observed criterion σ(I): 3 / 冗長度: 6.2 % / Biso Wilson estimate: 29.5 Å2 / Rmerge(I) obs: 0.047 / Net I/σ(I): 17.2 |
反射 シェル | 解像度: 1.5→1.55 Å / Rmerge(I) obs: 0.3 / Mean I/σ(I) obs: 2.9 / % possible all: 97.1 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 開始モデル: PDB ENTRY 2ACY 解像度: 1.5→10 Å / SU ML: 0.047 / ESU R Free: 0.079
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原子変位パラメータ | Biso mean: 26.9 Å2 | ||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.5→10 Å
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