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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1ucw | ||||||
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タイトル | COMPLEX OF TRANSALDOLASE WITH THE REDUCED SCHIFF-BASE INTERMEDIATE | ||||||
![]() | TRANSALDOLASE | ||||||
![]() | TRANSFERASE / KETONE RESIDUES / PENTOSE SHUNT | ||||||
機能・相同性 | ![]() transketolase or transaldolase activity / transaldolase / transaldolase activity / pentose-phosphate shunt, non-oxidative branch / carbohydrate metabolic process / membrane / cytosol 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Jia, J. / Lindqvist, Y. / Schneider, G. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Crystal structure of the reduced Schiff-base intermediate complex of transaldolase B from Escherichia coli: mechanistic implications for class I aldolases. 著者: Jia, J. / Schorken, U. / Lindqvist, Y. / Sprenger, G.A. / Schneider, G. #1: ![]() タイトル: Crystal Structure of Transaldolase B from Escherichia Coli Suggests a Circular Permutation of the Alpha/Beta Barrel within the Class I Aldolase Family 著者: Jia, J. / Huang, W. / Schorken, U. / Sahm, H. / Sprenger, G.A. / Lindqvist, Y. / Schneider, G. #2: ![]() タイトル: Crystallization and Preliminary X-Ray Crystallographic Analysis of Recombinant Transaldolase B from Escherichia Coli 著者: Jia, J. / Lindqvist, Y. / Schneider, G. / Schorken, U. / Sahm, H. / Sprenger, G.A. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 142.7 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 112.6 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 403.1 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 405.8 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 14.4 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 23.4 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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非結晶学的対称性 (NCS) | NCS oper: (Code: given Matrix: (1, -0.0067, 0.004), ベクター: |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 35360.199 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 詳細: THE LIGAND IS COVALENTLY BOUND TO THE SIDE CHAIN OF LYS 132 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() #2: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.94 Å3/Da / 溶媒含有率: 51.6 % | |||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS 温度: 293 K / pH: 4 / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 | |||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射光源 | 由来: SEALED TUBE / 波長: 1.5418 |
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検出器 | タイプ: MARRESEARCH / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 1996年3月14日 |
放射 | 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | Num. obs: 37868 / % possible obs: 87 % / Observed criterion σ(I): 0 / Rmerge(I) obs: 0.099 |
反射 シェル | 解像度: 2.2→2.25 Å / % possible all: 77.5 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 2.2 Å / Num. measured all: 173783 |
反射 シェル | *PLUS % possible obs: 77.5 % |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2.2→10 Å / σ(F): 0
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原子変位パラメータ | Biso mean: 21.08 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.2→10 Å
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拘束条件 |
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Refine LS restraints NCS | NCS model details: TWO-FOLD SYMMETRY RESTRAINTS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ソフトウェア | *PLUS 名称: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS |