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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1ubx | ||||||
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タイトル | STRUCTURE OF FARNESYL PYROPHOSPHATE SYNTHETASE | ||||||
![]() | FARNESYL DIPHOSPHATE SYNTHASE | ||||||
![]() | TRANSFERASE / ISOPRENE BIOSYNTHESIS / CHOLESTEROL BIOSYNTHESIS | ||||||
機能・相同性 | ![]() geranyl diphosphate biosynthetic process / dimethylallyltranstransferase / (2E,6E)-farnesyl diphosphate synthase / farnesyl diphosphate biosynthetic process / dimethylallyltranstransferase activity / geranyltranstransferase activity / cholesterol biosynthetic process / metal ion binding / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Tarshis, L.C. / Proteau, P. / Poulter, C.D. / Sacchettini, J.C. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Regulation of product chain length by isoprenyl diphosphate synthases. 著者: Tarshis, L.C. / Proteau, P.J. / Kellogg, B.A. / Sacchettini, J.C. / Poulter, C.D. #1: ![]() タイトル: Crystal Structure of Recombinant Farnesyl Diphosphate Synthase at 2.6-A Resolution 著者: Tarshis, L.C. / Yan, M. / Poulter, C.D. / Sacchettini, J.C. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 85.1 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 64.4 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 42071.105 Da / 分子数: 1 / 変異: F112A, F113S / 由来タイプ: 組換発現 / 詳細: COMPLEXED WITH FARNESYL DIPHOSPHATE AND MAGNESIUM / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() |
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#2: 化合物 | ChemComp-MG / |
#3: 化合物 | ChemComp-FPP / |
#4: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 3.23 Å3/Da / 溶媒含有率: 61.9 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS pH: 7 / 手法: unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射光源 | 波長: 1.5418 |
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検出器 | タイプ: SIEMENS-NICOLET X100 / 検出器: AREA DETECTOR / 日付: 1995年8月18日 |
放射 | 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | Num. obs: 19491 / % possible obs: 86 % / Observed criterion σ(I): 0.2 / 冗長度: 2.9 % / Rmerge(I) obs: 0.06 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 最高解像度: 2.5 Å / Num. reflection obs: 16544 / σ(F): 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 最高解像度: 2.5 Å
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拘束条件 |
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