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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1tt3 | ||||||
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タイトル | NMR soulution structure of omega-conotoxin [K10]MVIIA | ||||||
要素 | Omega-conotoxin MVIIa | ||||||
キーワード | TOXIN (毒素) / cysteine knot (シスチンノット) / four loop frame work | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 host cell presynaptic membrane / ion channel inhibitor activity / calcium channel regulator activity / toxin activity / extracellular region 類似検索 - 分子機能 | ||||||
手法 | 溶液NMR / Structures were calculated using torsion angle dynamics, simulated annealing protocol | ||||||
データ登録者 | Adams, D.J. / Smith, A.B. / Schroeder, C.I. / Yasuda, T. / Lewis, R.J. | ||||||
引用 | ジャーナル: J.Biol.Chem. / 年: 2003 タイトル: omega-conotoxin CVID inhibits a pharmacologically distinct voltage-sensitive calcium channel associated with transmitter release from preganglionic nerve terminals 著者: Adams, D.J. / Smith, A.B. / Schroeder, C.I. / Yasuda, T. / Lewis, R.J. #1: ジャーナル: to be published タイトル: The alfa2delta auxiliary subunit reduces the affinity of omega-conotoxins for recombinant N-type calcium channels 著者: Mould, J. / Yasuda, T. / Schroeder, C.I. / Beedle, A.M. / Doering, C.J. / Zamponi, G.W. / Adams, D.J. / Lewis, R.J. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1tt3.cif.gz | 135.8 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1tt3.ent.gz | 106.9 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1tt3.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/tt/1tt3 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/tt/1tt3 | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質・ペプチド | 分子量: 2622.210 Da / 分子数: 1 / 変異: R10K / 由来タイプ: 合成 詳細: This sequence contains a [R10K] mutation of the naturally occuring MVIIA from Conus magus 参照: UniProt: P05484 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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-試料調製
詳細 |
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試料状態 |
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-NMR測定
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M | |||||||||||||||
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放射波長 | 相対比: 1 | |||||||||||||||
NMRスペクトロメーター |
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-解析
NMR software |
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精密化 | 手法: Structures were calculated using torsion angle dynamics, simulated annealing protocol ソフトェア番号: 1 詳細: A total of 479 distance restraints (including H-bonds) and 30 dihedral angle restraints (including 21 phi, 9 chi) were used to calculate the structures. | ||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | ||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 50 / 登録したコンフォーマーの数: 22 |