登録構造単位 | A: Probable eukaryotic D-amino acid tRNA deacylase, LMAJ005534AAA B: Probable eukaryotic D-amino acid tRNA deacylase, LMAJ005534AAA C: Probable eukaryotic D-amino acid tRNA deacylase, LMAJ005534AAA D: Probable eukaryotic D-amino acid tRNA deacylase, LMAJ005534AAA
| 分子量 (理論値) | 分子数 |
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合計 (水以外) | 87,100 | 4 |
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ポリマ- | 87,100 | 4 |
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非ポリマー | 0 | 0 |
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水 | 6,882 | 382 |
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1 | A: Probable eukaryotic D-amino acid tRNA deacylase, LMAJ005534AAA B: Probable eukaryotic D-amino acid tRNA deacylase, LMAJ005534AAA
| 分子量 (理論値) | 分子数 |
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合計 (水以外) | 43,550 | 2 |
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ポリマ- | 43,550 | 2 |
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非ポリマー | 0 | 0 |
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水 | 36 | 2 |
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タイプ | 名称 | 対称操作 | 数 |
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identity operation | 1_555 | x,y,z | 1 |
Buried area | 2760 Å2 |
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ΔGint | -18 kcal/mol |
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Surface area | 17380 Å2 |
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手法 | PISA |
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2 | C: Probable eukaryotic D-amino acid tRNA deacylase, LMAJ005534AAA C: Probable eukaryotic D-amino acid tRNA deacylase, LMAJ005534AAA
| 分子量 (理論値) | 分子数 |
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合計 (水以外) | 43,550 | 2 |
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ポリマ- | 43,550 | 2 |
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非ポリマー | 0 | 0 |
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水 | 36 | 2 |
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タイプ | 名称 | 対称操作 | 数 |
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identity operation | 1_555 | x,y,z | 1 | crystal symmetry operation | 3_755 | -x+2,y,-z+1/2 | 1 |
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3 | D: Probable eukaryotic D-amino acid tRNA deacylase, LMAJ005534AAA D: Probable eukaryotic D-amino acid tRNA deacylase, LMAJ005534AAA
| 分子量 (理論値) | 分子数 |
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合計 (水以外) | 43,550 | 2 |
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ポリマ- | 43,550 | 2 |
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非ポリマー | 0 | 0 |
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水 | 36 | 2 |
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タイプ | 名称 | 対称操作 | 数 |
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identity operation | 1_555 | x,y,z | 1 | crystal symmetry operation | 4_575 | x,-y+2,-z | 1 |
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単位格子 | Length a, b, c (Å) | 67.479, 67.465, 174.410 |
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Angle α, β, γ (deg.) | 90.00, 90.00, 90.00 |
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Int Tables number | 17 |
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Space group name H-M | P2221 |
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Components on special symmetry positions | ID | モデル | 要素 |
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1 | 1 | D-568-HOH |
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非結晶学的対称性 (NCS) | NCSドメイン: ID | Ens-ID | 詳細 |
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1 | 1 | A2 | 1 | B3 | 1 | C4 | 1 | D5 | 1 | A6 | 1 | B7 | 1 | C8 | 1 | D9 | 1 | A10 | 1 | B11 | 1 | C12 | 1 | D13 | 1 | A14 | 1 | B15 | 1 | C16 | 1 | D17 | 1 | A18 | 1 | B19 | 1 | C20 | 1 | D21 | 1 | A22 | 1 | B23 | 1 | C24 | 1 | D25 | 1 | A26 | 1 | B27 | 1 | C28 | 1 | D1 | 2 | A2 | 2 | B3 | 2 | C4 | 2 | D | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |
NCSドメイン領域: Dom-ID | Component-ID | Ens-ID | Beg auth comp-ID | Beg label comp-ID | End auth comp-ID | End label comp-ID | Refine code | Auth asym-ID | Label asym-ID | Auth seq-ID | Label seq-ID |
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1 | 1 | 1 | HISHISVALVAL5 | AA8 - 13 | 8 - 13 | 2 | 1 | 1 | HISHISVALVAL5 | BB8 - 13 | 8 - 13 | 3 | 1 | 1 | METMETVALVAL5 | CC9 - 13 | 9 - 13 | 4 | 1 | 1 | METMETVALVAL5 | DD9 - 13 | 9 - 13 | 5 | 2 | 1 | METMETALAALA2 | AA14 - 51 | 14 - 51 | 6 | 2 | 1 | METMETALAALA2 | BB14 - 51 | 14 - 51 | 7 | 2 | 1 | METMETALAALA2 | CC14 - 51 | 14 - 51 | 8 | 2 | 1 | METMETALAALA2 | DD14 - 51 | 14 - 51 | 9 | 3 | 1 | HISHISGLYGLY2 | AA60 - 108 | 60 - 108 | 10 | 3 | 1 | HISHISGLYGLY2 | BB60 - 108 | 60 - 108 | 11 | 3 | 1 | HISHISGLYGLY2 | CC60 - 108 | 60 - 108 | 12 | 3 | 1 | HISHISGLYGLY2 | DD60 - 108 | 60 - 108 | 13 | 4 | 1 | ARGARGARGARG3 | AA | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |
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