[English] 日本語
Yorodumi- PDB-1tc5: Structural Analysis of a probable eukaryotic D-amino acid tRNA de... -
+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 1tc5 | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
Title | Structural Analysis of a probable eukaryotic D-amino acid tRNA deacylase | ||||||
Components | Probable eukaryotic D-amino acid tRNA deacylase, LMAJ005534AAA | ||||||
Keywords | STRUCTURAL GENOMICS / UNKNOWN FUNCTION / SGPP / PSI / Protein Structure Initiative / Structural Genomics of Pathogenic Protozoa Consortium | ||||||
Function / homology | Function and homology information D-aminoacyl-tRNA deacylase activity / Hydrolases; Acting on ester bonds / cytoplasm Similarity search - Function | ||||||
Biological species | Leishmania major (eukaryote) | ||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / Resolution: 1.93 Å | ||||||
Authors | Robien, M.A. / Hol, W.G.J. / Structural Genomics of Pathogenic Protozoa Consortium (SGPP) | ||||||
Citation | Journal: To be Published Title: Structural analysis of LMAJ005534AAA, a probable eukaryotic D-amino acid tRNA deacylase from Leishmania major Authors: Robien, M.A. / Hol, W.G.J. / Structural Genomics of Pathogenic Protozoa Consortium | ||||||
History |
| ||||||
Remark 999 | SEQUENCE NO SEQUENCE DATABASE REFERENCE WAS AVAILABLE AT THE TIME OF DEPOSITION. |
-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
---|
-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 1tc5.cif.gz | 161.3 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
---|---|---|---|---|
PDB format | pdb1tc5.ent.gz | 129.1 KB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 1tc5.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Summary document | 1tc5_validation.pdf.gz | 442.5 KB | Display | wwPDB validaton report |
---|---|---|---|---|
Full document | 1tc5_full_validation.pdf.gz | 448.8 KB | Display | |
Data in XML | 1tc5_validation.xml.gz | 31.4 KB | Display | |
Data in CIF | 1tc5_validation.cif.gz | 44.2 KB | Display | |
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/tc/1tc5 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/tc/1tc5 | HTTPS FTP |
-Related structure data
Similar structure data | |
---|---|
Other databases |
-Links
-Assembly
Deposited unit |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2 |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3 |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Unit cell |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Components on special symmetry positions |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
NCS domain segments:
|