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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1syg | ||||||
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タイトル | ENGINEERING ALTERNATIVE BETA-TURN TYPES IN STAPHYLOCOCCAL NUCLEASE | ||||||
![]() | STAPHYLOCOCCAL NUCLEASE![]() | ||||||
![]() | HYDROLASE(PHOSPHORIC DIESTER) | ||||||
機能・相同性 | ![]() endonuclease activity, active with either ribo- or deoxyribonucleic acids and producing 3'-phosphomonoesters / ![]() ![]() ![]() ![]() 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Hynes, T.R. / Hodel, A. / Fox, R.O. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Engineering alternative beta-turn types in staphylococcal nuclease. 著者: Hynes, T.R. / Hodel, A. / Fox, R.O. #1: ![]() タイトル: The Crystal Structure of Staphylococcal Nuclease Refined at 1.7 Angstroms Resolution 著者: Hynes, T.R. / Fox, R.O. #2: ![]() タイトル: Transfer of a Beta-Turn Structure to a New Protein Context 著者: Hynes, T.R. / Kautz, R.A. / Goodman, M.A. / Gill, J.F. / Fox, R.O. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 38.6 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 26.7 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | ![]() 分子量: 16817.293 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() 参照: UniProt: P00644, ![]() |
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#2: 水 | ChemComp-HOH / ![]() |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.21 Å3/Da / 溶媒含有率: 44.27 % | ||||||||||||||||||||
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結晶化![]() | *PLUS 温度: 5 ℃ / pH: 8.15 / 手法: unknown | ||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
反射 | *PLUS 最高解像度: 1.9 Å / 最低解像度: 6 Å / Num. obs: 10281 / % possible obs: 99 % / Num. measured all: 87597 / Rmerge(I) obs: 0.07 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | Rfactor Rwork![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 最高解像度: 1.9 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS Rfactor obs: 0.194 / Rfactor Rwork![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS タイプ: x_angle_d / Dev ideal: 1.586 |