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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1syc | ||||||
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タイトル | ENGINEERING ALTERNATIVE BETA-TURN TYPES IN STAPHYLOCOCCAL NUCLEASE | ||||||
![]() | STAPHYLOCOCCAL NUCLEASE | ||||||
![]() | HYDROLASE(PHOSPHORIC DIESTER) | ||||||
機能・相同性 | ![]() endonuclease activity, active with either ribo- or deoxyribonucleic acids and producing 3'-phosphomonoesters / micrococcal nuclease / nucleic acid binding / extracellular region / membrane / metal ion binding / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Hynes, T.R. / Hodel, A. / Fox, R.O. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Engineering alternative beta-turn types in staphylococcal nuclease. 著者: Hynes, T.R. / Hodel, A. / Fox, R.O. #1: ![]() タイトル: The Crystal Structure of Staphylococcal Nuclease Refined at 1.7 Angstroms Resolution 著者: Hynes, T.R. / Fox, R.O. #2: ![]() タイトル: Transfer of a Beta-Turn Structure to a New Protein Context 著者: Hynes, T.R. / Kautz, R.A. / Goodman, M.A. / Gill, J.F. / Fox, R.O. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 39.3 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 27.3 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 16803.268 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 参照: UniProt: P00644, micrococcal nuclease |
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#2: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.22 Å3/Da / 溶媒含有率: 44.63 % | ||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS 温度: 25 ℃ / pH: 8.15 / 手法: unknown | ||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
反射 | *PLUS 最高解像度: 1.8 Å / 最低解像度: 8 Å / Num. obs: 20238 / % possible obs: 59 % / Num. measured all: 33206 / Rmerge(I) obs: 0.013 |
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解析
ソフトウェア | 名称: PROLSQ / 分類: 精密化 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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精密化 | 解像度: 1.8→8 Å / Rfactor obs: 0.182 / σ(F): 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.8→8 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: PROLSQ / 分類: refinement | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS Rfactor obs: 0.182 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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