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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1rae | ||||||
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タイトル | CRYSTAL STRUCTURE OF CTP-LIGATED T STATE ASPARTATE TRANSCARBAMOYLASE AT 2.5 ANGSTROMS RESOLUTION: IMPLICATIONS FOR ATCASE MUTANTS AND THE MECHANISM OF NEGATIVE COOPERATIVITY | ||||||
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![]() | TRANSFERASE | ||||||
機能・相同性 | ![]() aspartate carbamoyltransferase complex / pyrimidine nucleotide biosynthetic process / aspartate carbamoyltransferase / aspartate carbamoyltransferase activity / amino acid binding / glutamine metabolic process / protein homotrimerization / 'de novo' UMP biosynthetic process / 'de novo' pyrimidine nucleobase biosynthetic process / zinc ion binding ...aspartate carbamoyltransferase complex / pyrimidine nucleotide biosynthetic process / aspartate carbamoyltransferase / aspartate carbamoyltransferase activity / amino acid binding / glutamine metabolic process / protein homotrimerization / 'de novo' UMP biosynthetic process / 'de novo' pyrimidine nucleobase biosynthetic process / zinc ion binding / identical protein binding / cytoplasm / cytosol 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Kosman, R.P. / Gouaux, J.E. / Lipscomb, W.N. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Crystal structure of CTP-ligated T state aspartate transcarbamoylase at 2.5 A resolution: implications for ATCase mutants and the mechanism of negative cooperativity. 著者: Kosman, R.P. / Gouaux, J.E. / Lipscomb, W.N. #1: ![]() タイトル: Structural Consequences of Effector Binding to the T State of Aspartate Carbamoyltransferase: Crystal Structures of the Unligated and ATP-and Ctp-Complexed Enzymes at 2.6 Angstroms Resolution 著者: Stevens, R.C. / Gouaux, J.E. / Lipscomb, W.N. #2: ![]() タイトル: Structural Asymmetry in the Ctp-Liganded Form of Aspartate Carbamoyltransferase from Escherichia Coli 著者: Kim, K.H. / Pan, Z. / Honzatko, R.B. / Ke, H.-M. / Lipscomb, W.N. #3: ![]() タイトル: Location of Amino Acid Alterations in Mutants of Aspartate Transcarbamoylase: Structural Aspects of Interallelic Complementation 著者: Schachman, H.K. / Pauza, C.D. / Navre, M. / Karels, M.J. / Wu, L. / Yang, Y.R. #4: ![]() タイトル: Nucleotide Sequence of the Structural Gene (Pyrb) that Encodes the Catalytic Polypeptide of Aspartate Transcarbamoylase of Escherichia Coli 著者: Hoover, T.A. / Roof, W.D. / Foltermann, K.F. / O'Donovan, G.A. / Bencini, D.A. / Wild, J.R. #5: ![]() タイトル: Amino Acid Sequence of the Catalytic Subunit of Aspartate Transcarbamoylase from Escherichia Coli 著者: Konigsberg, W.H. / Henderson, L. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 193.6 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 153.6 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 531.6 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 570.9 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 23.8 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 35.2 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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単位格子 |
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Atom site foot note | 1: CIS PROLINE - PRO A 268 / 2: CIS PROLINE - PRO C 268 3: LEU D 48 - PRO D 49 OMEGA =146.25 PEPTIDE BOND DEVIATES SIGNIFICANTLY FROM TRANS CONFORMATION |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 34337.105 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() #2: タンパク質 | 分子量: 17143.625 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() #3: 化合物 | #4: 化合物 | #5: 水 | ChemComp-HOH / | 配列の詳細 | THE AMINO ACID SEQUENCE OF ESCHERICHIA COLI ATCASE USED IN THIS ENTRY REPRESENTS A DEPARTURE FROM ...THE AMINO ACID SEQUENCE OF ESCHERICHI | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.98 Å3/Da / 溶媒含有率: 58.71 % | ||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS pH: 5.8 / 手法: microdialysis詳細: taken from Gouaux, J. E. et al (1989). Biochemistry, 28, 1798-1803. | ||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 2.5 Å / 最低解像度: 10 Å / Num. obs: 35204 / % possible obs: 82 % / Observed criterion σ(I): 2 / Num. measured all: 169691 / Rmerge(I) obs: 0.097 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | Rfactor Rwork: 0.189 / Rfactor obs: 0.189 / 最高解像度: 2.5 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 最高解像度: 2.5 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS Rfactor obs: 0.189 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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