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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1qyp | ||||||
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タイトル | THERMOCOCCUS CELER RPB9, NMR, 25 STRUCTURES | ||||||
要素 | RNA POLYMERASE II | ||||||
キーワード | TRANSCRIPTION / RNA POLYMERASE II SUBUNIT / RPB9 / ZN RIBBON / HYPERTHERMOPHILIC / EXTREMOPHILE | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 DNA-templated transcription / regulation of DNA-templated transcription / DNA binding / zinc ion binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Thermococcus celer (古細菌) | ||||||
手法 | 溶液NMR | ||||||
データ登録者 | Wang, B. / Jones, D.N.M. / Kaine, B.P. / Weiss, M.A. | ||||||
引用 | ジャーナル: Structure / 年: 1998 タイトル: High-resolution structure of an archaeal zinc ribbon defines a general architectural motif in eukaryotic RNA polymerases. 著者: Wang, B. / Jones, D.N. / Kaine, B.P. / Weiss, M.A. #1: ジャーナル: Nature / 年: 1995 タイトル: Erratum. Structure of a New Nucleic-Acid-Binding Motif in Eukaryotic Transcriptional Elongation Factor Tfiis 著者: Qian, X. / Jeon, C. / Yoon, H. / Agarwal, K. / Weiss, M.A. #2: ジャーナル: Nature / 年: 1993 タイトル: Structure of a New Nucleic-Acid-Binding Motif in Eukaryotic Transcriptional Elongation Factor Tfiis 著者: Qian, X. / Jeon, C. / Yoon, H. / Agarwal, K. / Weiss, M.A. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1qyp.cif.gz | 442.9 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1qyp.ent.gz | 369 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1qyp.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 1qyp_validation.pdf.gz | 343.7 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 1qyp_full_validation.pdf.gz | 517.8 KB | 表示 | |
XML形式データ | 1qyp_validation.xml.gz | 34.5 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 1qyp_validation.cif.gz | 53 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/qy/1qyp ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/qy/1qyp | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 6642.467 Da / 分子数: 1 / 断片: SUBUNIT RPB9, C-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 58 -110 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Thermococcus celer (古細菌) / 細胞株: BL21 / プラスミド: PET15-B / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21 (DE3) LYSS / 参照: UniProt: Q56254 |
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#2: 化合物 | ChemComp-ZN / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR |
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-試料調製
試料状態 | pH: 6 / 温度: 313 K |
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結晶化 | *PLUS 手法: other / 詳細: NMR |
-解析
ソフトウェア |
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NMR software | 名称: X-PLOR / 開発者: BRUNGER / 分類: 精密化 | ||||||||||||
NMRアンサンブル | 登録したコンフォーマーの数: 25 |