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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1qor | ||||||
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タイトル | CRYSTAL STRUCTURE OF ESCHERICHIA COLI QUINONE OXIDOREDUCTASE COMPLEXED WITH NADPH | ||||||
![]() | QUINONE OXIDOREDUCTASE | ||||||
![]() | OXIDOREDUCTASE | ||||||
機能・相同性 | ![]() mRNA 3'-UTR AU-rich region binding => GO:0035925 / NADPH:quinone reductase / NADPH:quinone reductase activity / cellular response to oxidative stress / zinc ion binding / cytoplasm / cytosol 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Thorn, J.M. / Barton, J.D. / Dixon, N.E. / Ollis, D.L. / Edwards, K.J. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Crystal structure of Escherichia coli QOR quinone oxidoreductase complexed with NADPH. 著者: Thorn, J.M. / Barton, J.D. / Dixon, N.E. / Ollis, D.L. / Edwards, K.J. #1: ![]() タイトル: Crystallization and Preliminary X-Ray Diffraction Studies on a Soluble Escherichia Coli Quinone Oxidoreductase 著者: Edwards, K.J. / Thorn, J.M. / Daniher, J.A. / Dixon, N.E. / Ollis, D.L. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 142.4 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 112.6 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 558.8 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 573.6 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 16.5 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 26.4 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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Atom site foot note | 1: CIS PROLINE - PRO A 58 / 2: CIS PROLINE - PRO B 58 | ||||||||
非結晶学的対称性 (NCS) | NCS oper: (Code: given Matrix: (-0.60988, 0.11191, 0.78455), ベクター: 詳細 | MTRIX THE TRANSFORMATIONS PRESENTED ON MTRIX RECORDS BELOW DESCRIBE NON-CRYSTALLOGRAPHIC RELATIONSHIPS AMONG THE VARIOUS DOMAINS IN THIS ENTRY. APPLYING THE APPROPRIATE MTRIX TRANSFORMATION TO THE RESIDUES LISTED FIRST WILL YIELD APPROXIMATE COORDINATES FOR THE RESIDUES LISTED SECOND. APPLIED TO TRANSFORMED TO MTRIX RESIDUES RESIDUES RMSD M1 A 2 .. A 327 B 2 .. B 327 0.180 | |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 35213.082 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() #2: 化合物 | #3: 化合物 | #4: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 3.07 Å3/Da / 溶媒含有率: 59.97 % | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS 温度: 4 ℃ / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / PH range low: 9 / PH range high: 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 2.2 Å / Num. obs: 40569 / % possible obs: 90.6 % / Rmerge(I) obs: 0.073 |
反射 シェル | *PLUS 最高解像度: 2.2 Å / 最低解像度: 2.5 Å / % possible obs: 75.6 % |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | Rfactor Rwork: 0.14 / Rfactor obs: 0.14 / 最高解像度: 2.2 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 最高解像度: 2.2 Å
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拘束条件 |
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精密化 | *PLUS 最低解像度: 5 Å / Num. reflection all: 36270 / σ(F): 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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