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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1pzc | ||||||
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タイトル | APO-PSEUDOAZURIN (METAL FREE PROTEIN) | ||||||
![]() | PSEUDOAZURIN | ||||||
![]() | ELECTRON TRANSFER (CUPROPROTEIN) / APOPROTEIN / METAL FREE PROTEIN | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||
![]() | Petratos, K. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: The crystal structure of apo-pseudoazurin from Alcaligenes faecalis S-6. 著者: Petratos, K. / Papadovasilaki, M. / Dauter, Z. #1: ![]() タイトル: Refinement of the Structure of Pseudoazurin from Alcaligenes Faecalis S-6 at 1.55 Angstroms Resolution 著者: Petratos, K. / Dauter, Z. / Wilson, K.S. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 37.7 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 26.1 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 408.6 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 409.3 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 8.5 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 11.5 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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Atom site foot note | 1: CIS PROLINE - PRO 20 / 2: ATOM O HOH 136 WAS REFINED WITH OCCUPANCY SET TO 0.50. / 3: ATOM O HOH 137 WAS REFINED WITH OCCUPANCY SET TO 0.50. |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 13383.511 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 詳細: APO FORM 由来: (組換発現) ![]() 株: S-6 / プラスミド: PUB1 / 発現宿主: ![]() ![]() | ||
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#2: 水 | ChemComp-HOH / | ||
構成要素の詳細 | DE-METALLIZED由来についての詳細 | MOLECULE_NAME: PSEUDOAZURIN. THE PSEUDOAZURIN GENE FROM A. FAECALIS (438 B.P.) WAS EXPRESSED UNDER ...MOLECULE_NAME: PSEUDOAZUR | |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.61 Å3/Da / 溶媒含有率: 52.95 % | ||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | pH: 6.7 / 詳細: pH 6.7 | ||||||||||||||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS pH: 5.7 / 手法: 蒸気拡散法 / 詳細: Petratos, K., (1987) FEBS Lett., 218, 209. | ||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
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検出器 | タイプ: MARRESEARCH / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 1994年7月13日 |
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 0.87 Å / 相対比: 1 |
反射 | Num. obs: 11533 / % possible obs: 98.4 % / Observed criterion σ(I): 1 / 冗長度: 6.4 % / Rmerge(I) obs: 0.077 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 1.85 Å / 最低解像度: 10 Å / Num. obs: 11516 / Num. measured all: 73694 / Rmerge(I) obs: 0.077 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 1.85→10 Å / σ(F): 1 /
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原子変位パラメータ | Biso mean: 29 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.85→10 Å
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拘束条件 |
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精密化 | *PLUS % reflection Rfree: 10 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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