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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1pgb | ||||||
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タイトル | TWO CRYSTAL STRUCTURES OF THE B1 IMMUNOGLOBULIN-BINDING DOMAIN OF STREPTOCCOCAL PROTEIN G AND COMPARISON WITH NMR | ||||||
要素 | PROTEIN G | ||||||
キーワード | IMMUNOGLOBULIN BINDING PROTEIN | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 | ||||||
生物種 | Streptococcus sp. GX7805 (バクテリア) | ||||||
手法 | X線回折 / 解像度: 1.92 Å | ||||||
データ登録者 | Gallagher, T. / Alexander, P. / Bryan, P. / Gilliland, G.L. | ||||||
引用 | ジャーナル: Biochemistry / 年: 1994 タイトル: Two crystal structures of the B1 immunoglobulin-binding domain of streptococcal protein G and comparison with NMR. 著者: Gallagher, T. / Alexander, P. / Bryan, P. / Gilliland, G.L. #1: ジャーナル: Biochemistry / 年: 1992 タイトル: 1.67 Angstroms X-Ray Structure of the B2 Immunoglobulin-Binding Domain of Streptoccocal Protein G and Comparison to the NMR Structure of the B1 Domain 著者: Achari, A. / Hale, S.P. / Howard, A.J. / Clore, G.M. / Gronenborn, A.M. / Hardman, K.D. / Whitlow, M. #2: ジャーナル: Science / 年: 1991 タイトル: A Novel, Highly Stable Fold of the Immunoglobulin Binding Domain of Streptococcal Protein G 著者: Gronenborn, A.M. / Filpula, D.R. / Essig, N.Z. / Achari, A. / Whitlow, M. / Wingfield, P.T. / Clore, G.M. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1pgb.cif.gz | 20.5 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1pgb.ent.gz | 12.7 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1pgb.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 1pgb_validation.pdf.gz | 355.2 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 1pgb_full_validation.pdf.gz | 355.4 KB | 表示 | |
XML形式データ | 1pgb_validation.xml.gz | 2.6 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 1pgb_validation.cif.gz | 3.5 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/pg/1pgb ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/pg/1pgb | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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単位格子 |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 6201.784 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) Streptococcus sp. GX7805 (バクテリア) 参照: UniProt: P06654 |
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#2: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: X線回折 |
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-試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.48 Å3/Da / 溶媒含有率: 50.31 % | ||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS 温度: 18 ℃ / pH: 4 / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 | ||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 1.86 Å / Num. obs: 5014 / Rmerge(I) obs: 0.068 |
反射 シェル | *PLUS Mean I/σ(I) obs: 4.9 |
-解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 1.92→6 Å / σ(I): 1 /
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.92→6 Å
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拘束条件 |
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精密化 | *PLUS Rfactor obs: 0.198 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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