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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1p0v | ||||||
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タイトル | F393A mutant heme domain of flavocytochrome P450 BM3 | ||||||
![]() | Bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase | ||||||
![]() | OXIDOREDUCTASE / cytochrome P450 / fatty acid hydroxylase / monooxygenase | ||||||
機能・相同性 | ![]() NADPH-hemoprotein reductase / NADPH-hemoprotein reductase activity / oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen, reduced flavin or flavoprotein as one donor, and incorporation of one atom of oxygen / unspecific monooxygenase / aromatase activity / metabolic process / response to hormone / FMN binding / flavin adenine dinucleotide binding / iron ion binding ...NADPH-hemoprotein reductase / NADPH-hemoprotein reductase activity / oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen, reduced flavin or flavoprotein as one donor, and incorporation of one atom of oxygen / unspecific monooxygenase / aromatase activity / metabolic process / response to hormone / FMN binding / flavin adenine dinucleotide binding / iron ion binding / heme binding / identical protein binding / cytosol 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Ost, T.W.B. / Clark, J. / Miles, C.S. / Walkinshaw, M.D. / Reid, G.A. / Chapman, S.K. / Daff, S. / Mowat, C.G. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Oxygen Activation and Electron Transfer in Flavocytochrome P450 BM3 著者: Ost, T.W.B. / Clark, J. / Mowat, C.G. / Miles, C.S. / Walkinshaw, M.D. / Reid, G.A. / Chapman, S.K. / Daff, S. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 222.1 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 174 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 543.5 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 564.4 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 20.9 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 38.6 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 52093.367 Da / 分子数: 2 / 断片: Heme domain, residues 1-455 of SWS P14779 / 変異: F393A / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 遺伝子: CYP102A21 / プラスミド: pCM80 / 発現宿主: ![]() ![]() #2: 化合物 | #3: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.63 Å3/Da / 溶媒含有率: 53.16 % | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | 温度: 277 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 6.5 詳細: PEG 8000, PIPES, MAGNESIUM SULFATE, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS 温度: 4 ℃ / pH: 7.4 / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: MARRESEARCH / 検出器: CCD / 日付: 2001年7月1日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 0.8482 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.05→20 Å / Num. all: 67927 / Num. obs: 66956 / % possible obs: 98.7 % / Observed criterion σ(I): -3 / Biso Wilson estimate: 24 Å2 / Rmerge(I) obs: 0.086 / Net I/σ(I): 8.6 |
反射 シェル | 解像度: 2.05→2.12 Å / Rmerge(I) obs: 0.245 / Mean I/σ(I) obs: 1.89 / Num. unique all: 6743 / % possible all: 99.7 |
反射 | *PLUS 最低解像度: 20 Å / Num. measured all: 361447 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 開始モデル: PDB ID 2HPD 解像度: 2.05→20 Å / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / σ(I): 0 / 立体化学のターゲット値: Engh & Huber
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原子変位パラメータ | Biso mean: 24 Å2 | |||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.05→20 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル | 解像度: 2.05→2.146 Å /
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精密化 | *PLUS % reflection Rfree: 5 % | |||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | |||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | |||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS タイプ: p_angle_d |