ソフトウェア | 名称 | バージョン | 分類 |
---|
CNS | 1.1 | 精密化 | HKL-2000 | | データ削減 | SCALEPACK | | データスケーリング | CNS | | 位相決定 |
|
---|
精密化 | 構造決定の手法: 単波長異常分散 / 解像度: 1.43→19.83 Å / Rfactor Rfree error: 0.003 / Isotropic thermal model: RESTRAINED / σ(F): 0 / 立体化学のターゲット値: Engh & Huber
| Rfactor | 反射数 | %反射 | Selection details |
---|
Rfree | 0.179 | 4829 | 4.9 % | RANDOM |
---|
Rwork | 0.163 | - | - | - |
---|
all | 0.163 | 97892 | - | - |
---|
obs | 0.163 | 97892 | 98.8 % | - |
---|
|
---|
溶媒の処理 | Bsol: 49.5037 Å2 / ksol: 0.376664 e/Å3 |
---|
原子変位パラメータ | Biso mean: 10.8 Å2
| Baniso -1 | Baniso -2 | Baniso -3 |
---|
1- | -0.06 Å2 | 0 Å2 | 0 Å2 |
---|
2- | - | -0.23 Å2 | 0 Å2 |
---|
3- | - | - | 0.28 Å2 |
---|
|
---|
Refine analyze | Luzzati coordinate error free: 0.14 Å / Luzzati sigma a free: 0.07 Å |
---|
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.43→19.83 Å
| タンパク質 | 核酸 | リガンド | 溶媒 | 全体 |
---|
原子数 | 2458 | 0 | 5 | 375 | 2838 |
---|
|
---|
拘束条件 | Refine-ID | タイプ | Dev ideal | Dev ideal target |
---|
X-RAY DIFFRACTION | c_bond_d0.008 | | X-RAY DIFFRACTION | c_angle_deg1.4 | | X-RAY DIFFRACTION | c_dihedral_angle_d21.8 | | X-RAY DIFFRACTION | c_improper_angle_d0.84 | | X-RAY DIFFRACTION | c_mcbond_it0.88 | 1.5 | X-RAY DIFFRACTION | c_mcangle_it1.26 | 2 | X-RAY DIFFRACTION | c_scbond_it2.1 | 2 | X-RAY DIFFRACTION | c_scangle_it2.63 | 2.5 | | | | | | | | |
|
---|
LS精密化 シェル | 解像度: 1.43→1.52 Å / Rfactor Rfree error: 0.007 / Total num. of bins used: 6
| Rfactor | 反射数 | %反射 |
---|
Rfree | 0.201 | 826 | 5.2 % |
---|
Rwork | 0.171 | 15111 | - |
---|
obs | - | - | 96.8 % |
---|
|
---|
Xplor file | Refine-ID | Serial no | Topol file |
---|
X-RAY DIFFRACTION | 1 | PROTEIN.TOPX-RAY DIFFRACTION | 2 | ION.TOPX-RAY DIFFRACTION | 3 | WATER.TOP | | |
|
---|
精密化 | *PLUS 最低解像度: 20 Å / Num. reflection obs: 51872 / Num. reflection Rfree: 2594 / % reflection Rfree: 5 % |
---|
溶媒の処理 | *PLUS |
---|
原子変位パラメータ | *PLUS |
---|
拘束条件 | *PLUS Refine-ID | タイプ | Dev ideal |
---|
X-RAY DIFFRACTION | c_angle_deg1.37 | X-RAY DIFFRACTION | c_dihedral_angle_d | X-RAY DIFFRACTION | c_dihedral_angle_deg21.8 | X-RAY DIFFRACTION | c_improper_angle_d | X-RAY DIFFRACTION | c_improper_angle_deg0.84 | | | | | |
|
---|