PDB-1onu: NMDA RECEPTOR ANTAGONIST, CONANTOKIN-G, NMR, 17 STRUCTURES

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 1onu

タイトル

NMDA RECEPTOR ANTAGONIST, CONANTOKIN-G, NMR, 17 STRUCTURES

要素

CONANTOKIN-G

キーワード

ANTAGONIST / NMDA RECEPTOR / CONANTOKIN-T

機能・相同性

Conantokin, conserved site / Conantokin family signature. / host cell postsynaptic membrane / ion channel regulator activity / toxin activity / extracellular region / metal ion binding / Conantokin-G

機能・相同性情報

生物種

Conus geographus (アンボイナ)

手法

溶液NMR / MOLECULAR DYNAMICS, SIMULATED ANNEALING

データ登録者

Skjaerbaek, N. / Nielsen, K.J. / Lewis, R.J. / Alewood, P.F. / Craik, D.J.

引用

ジャーナル: J.Biol.Chem. / 年: 1997
タイトル: Determination of the solution structures of conantokin-G and conantokin-T by CD and NMR spectroscopy.
著者: Skjaerbaek, N. / Nielsen, K.J. / Lewis, R.J. / Alewood, P. / Craik, D.J.

履歴

登録	1996年8月27日	処理サイト: BNL
改定 1.0	1997年9月4日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2008年3月24日	Group: Version format compliance
改定 1.2	2011年7月13日	Group: Version format compliance
改定 1.3	2022年2月23日	Group: Database references / Derived calculations / Other カテゴリ: database_2 / pdbx_database_status ...database_2 / pdbx_database_status / pdbx_struct_assembly / pdbx_struct_oper_list / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_database_status.process_site / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	1onu.cif.gz	89.9 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb1onu.ent.gz	71.2 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	1onu.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

-
検証レポート

文書・要旨	1onu_validation.pdf.gz	357.4 KB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	1onu_full_validation.pdf.gz	438.6 KB	表示
XML形式データ	1onu_validation.xml.gz	10.1 KB	表示
CIF形式データ	1onu_validation.cif.gz	13.5 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/on/1onu ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/on/1onu	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	1ontC C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	1s7p-d 6hng-d 2ruo-d 1kz2-d 4kyt-2 2rsw-d 1d0w-d 2lwq-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

-
リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI

登録構造単位

A: CONANTOKIN-G

2.27 kDa, 1 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

登録構造と同一
登録者が定義した集合体

NMR アンサンブル

	データ	基準
コンフォーマー数 (登録 / 計算)	17 / 30	ENERGY
代表モデル

#1: タンパク質・ペプチド	CONANTOKIN-G / CON-G 分子量: 2265.196 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Conus geographus (アンボイナ) / 参照: UniProt: P07231

-
実験

実験

手法: 溶液NMR

NMR実験

Conditions-ID	Experiment-ID	Solution-ID	タイプ
1	1	1	NOESY
1	2	1	TOCSY
1	3	1	DQF-COSY

-
試料調製

試料状態	pH: 3.5 / 温度: 280 K
結晶化	*PLUS 手法: other / 詳細: NMR

-
NMR測定

NMRスペクトロメーター	タイプ: Bruker ARX 500 / 製造業者: Bruker / モデル: ARX 500 / 磁場強度: 500 MHz

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
X-PLOR	3.1	モデル構築
X-PLOR	3.1	精密化
X-PLOR	3.1	位相決定

NMR software

名称	バージョン	開発者	分類
X-PLOR	3.1	BRUNGER	精密化
X-PLOR	3.1		構造決定

精密化

手法: MOLECULAR DYNAMICS, SIMULATED ANNEALING / ソフトェア番号: 1

NMRアンサンブル

コンフォーマー選択の基準: ENERGY / 計算したコンフォーマーの数: 30 / 登録したコンフォーマーの数: 17

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EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

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関連情報:EMDBヘッダ

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新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

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