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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1nya | ||||||
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タイトル | NMR SOLUTION STRUCTURE OF CALERYTHRIN, AN EF-HAND CALCIUM-BINDING PROTEIN | ||||||
要素 | Calerythrin | ||||||
キーワード | METAL BINDING PROTEIN / EF-hand | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 | ||||||
生物種 | Saccharopolyspora erythraea (バクテリア) | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ||||||
データ登録者 | Tossavainen, H. / Permi, P. / Annila, A. / Kilpelainen, I. / Drakenberg, T. | ||||||
引用 | ジャーナル: Eur.J.Biochem. / 年: 2003 タイトル: NMR solution structure of calerythrin, an EF-hand calcium-binding protein from Saccharopolyspora erythraea 著者: Tossavainen, H. / Permi, P. / Annila, A. / Kilpelainen, I. / Drakenberg, T. #1: ジャーナル: Protein Sci. / 年: 1999 タイトル: NMR assignments, secondary structure, and global fold of calerythrin, an EF-hand calcium-binding protein from Saccharopolyspora erythraea 著者: Aitio, H. / Annila, A. / Heikkinen, S. / Thulin, E. / Drakenberg, T. / Kilpelainen, I. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1nya.cif.gz | 1020.6 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1nya.ent.gz | 852 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1nya.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ny/1nya ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ny/1nya | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 19058.025 Da / 分子数: 1 / 変異: T108I,W109V / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) Saccharopolyspora erythraea (バクテリア) 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P06495 |
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#2: 化合物 |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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-試料調製
詳細 |
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試料状態 |
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結晶化 | *PLUS 手法: other / 詳細: NMR |
-NMR測定
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M | ||||||||||||||||||||
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放射波長 | 相対比: 1 | ||||||||||||||||||||
NMRスペクトロメーター |
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-解析
NMR software |
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精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | ||||||||||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 225 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |