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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1ngg | ||||||
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タイトル | STRUCTURAL BASIS OF THE 70-KILODALTON HEAT SHOCK COGNATE PROTEIN ATP HYDROLYTIC ACTIVITY, II. STRUCTURE OF THE ACTIVE SITE WITH ADP OR ATP BOUND TO WILD TYPE AND MUTANT ATPASE FRAGMENT | ||||||
![]() | HEAT-SHOCK COGNATE 70 kD PROTEIN | ||||||
![]() | HYDROLASE(ACTING ON ACID ANHYDRIDES) | ||||||
機能・相同性 | ![]() Regulation of HSF1-mediated heat shock response / Attenuation phase / HSF1-dependent transactivation / Protein methylation / GABA synthesis, release, reuptake and degradation / PKR-mediated signaling / mRNA Splicing - Major Pathway / HSP90 chaperone cycle for steroid hormone receptors (SHR) in the presence of ligand / chaperone-mediated autophagy translocation complex disassembly / slow axonal transport ...Regulation of HSF1-mediated heat shock response / Attenuation phase / HSF1-dependent transactivation / Protein methylation / GABA synthesis, release, reuptake and degradation / PKR-mediated signaling / mRNA Splicing - Major Pathway / HSP90 chaperone cycle for steroid hormone receptors (SHR) in the presence of ligand / chaperone-mediated autophagy translocation complex disassembly / slow axonal transport / clathrin-uncoating ATPase activity / protein targeting to lysosome involved in chaperone-mediated autophagy / late endosomal microautophagy / synaptic vesicle uncoating / AUF1 (hnRNP D0) binds and destabilizes mRNA / clathrin coat disassembly / Clathrin-mediated endocytosis / Prp19 complex / presynaptic cytosol / postsynaptic cytosol / Neutrophil degranulation / non-chaperonin molecular chaperone ATPase / chaperone cofactor-dependent protein refolding / autophagosome / protein folding chaperone / heat shock protein binding / RNA splicing / ATP-dependent protein folding chaperone / spliceosomal complex / terminal bouton / mRNA processing / melanosome / protein-macromolecule adaptor activity / protein refolding / ribonucleoprotein complex / lysosomal membrane / negative regulation of DNA-templated transcription / dendrite / nucleolus / ATP hydrolysis activity / ATP binding / nucleus / plasma membrane / cytoplasm / cytosol 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Flaherty, K.M. / Wilbanks, S.M. / Deluca-Flaherty, C. / Mckay, D.B. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structural basis of the 70-kilodalton heat shock cognate protein ATP hydrolytic activity. II. Structure of the active site with ADP or ATP bound to wild type and mutant ATPase fragment. 著者: Flaherty, K.M. / Wilbanks, S.M. / DeLuca-Flaherty, C. / McKay, D.B. #1: ![]() タイトル: Three-Dimensional Structure of the ATPase Fragment of a 70K Heat-Shock Cognate Protein 著者: Flaherty, K.M. / Deluca-Flaherty, C. / Mckay, D.B. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 90.9 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 67.9 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 458.5 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 463.5 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 9.4 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 14.9 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 42485.027 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() |
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#2: 化合物 | ChemComp-MG / |
#3: 化合物 | ChemComp-ATP / |
#4: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.61 Å3/Da / 溶媒含有率: 52.8 % | ||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS pH: 9.5 / 手法: unknown / 詳細: pH is adjusted to 9.5 with NaOH | ||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | *PLUS Rmerge(I) obs: 0.035 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2.19→6 Å / σ(F): 2 /
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.19→6 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS Rfactor obs: 0.191 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS タイプ: x_angle_d / Dev ideal: 1.4 |