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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1ndh | ||||||
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タイトル | CRYSTAL STRUCTURE OF NADH-CYTOCHROME B5 REDUCTASE FROM PIG LIVER AT 2.4 ANGSTROMS RESOLUTION | ||||||
![]() | CYTOCHROME B5 REDUCTASE | ||||||
![]() | ELECTRON TRANSPORT (FLAVO PROTEIN) | ||||||
機能・相同性 | ![]() cytochrome-b5 reductase / cytochrome-b5 reductase activity, acting on NAD(P)H / cholesterol biosynthetic process / FAD binding / flavin adenine dinucleotide binding / mitochondrial outer membrane / endoplasmic reticulum membrane / mitochondrion 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Nishida, H. / Miki, K. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Crystal structure of NADH-cytochrome b5 reductase from pig liver at 2.4 A resolution. 著者: Nishida, H. / Inaka, K. / Yamanaka, M. / Kaida, S. / Kobayashi, K. / Miki, K. #1: ![]() タイトル: The Specific Arrangement of Three Amino Acidic Residues for Flavin Binding Barrel Structures in Nadh-Cytochrome B5 Reductase and the Other Flavin Dependent Reductases 著者: Nishida, H. / Inaka, K. / Miki, K. | ||||||
履歴 |
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Remark 700 | SHEET SHEET SHEET_ID: S1, BETA-BARREL. |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 69.4 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 50.3 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 468.5 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 510 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 13.4 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 18.5 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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Atom site foot note | 1: CIS PROLINE - PRO 116 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 30873.674 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() |
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#2: 化合物 | ChemComp-FAD / |
#3: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.51 Å3/Da / 溶媒含有率: 51.06 % | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS 温度: 4 or 20 ℃ / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / 詳細: Miki, K., (1987) J. Biol. Chem., 262, 11801. / PH range low: 8 / PH range high: 6.8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | *PLUS Num. obs: 18695 / Rmerge(I) obs: 0.055 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2.1→5 Å /
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.1→5 Å
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拘束条件 |
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精密化 | *PLUS 最高解像度: 2.1 Å / Num. reflection obs: 10350 / Rfactor Rwork: 0.237 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS タイプ: x_angle_d / Dev ideal: 3.3 |