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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1mgn | ||||||
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タイトル | HIS64(E7)-> TYR APOMYOGLOBIN AS A REAGENT FOR MEASURING RATES OF HEMIN DISSOCIATION | ||||||
![]() | METMYOGLOBIN | ||||||
![]() | OXYGEN TRANSPORT | ||||||
機能・相同性 | ![]() nitrite reductase activity / 酸化還元酵素; 他の含窒素化合物が電子供与する / sarcoplasm / 酸化還元酵素; 過酸化物を電子受容体にする; ペルオキシダーゼ / removal of superoxide radicals / oxygen carrier activity / oxygen binding / peroxidase activity / heme binding / extracellular exosome / metal ion binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Hargrove, M.S. / Quillin, M.L. / Phillips Jr., G.N. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: His64(E7)-->Tyr apomyoglobin as a reagent for measuring rates of hemin dissociation. 著者: Hargrove, M.S. / Singleton, E.W. / Quillin, M.L. / Ortiz, L.A. / Phillips Jr., G.N. / Olson, J.S. / Mathews, A.J. #1: ![]() タイトル: High Resolution Crystal Structures of Five Distal Histidine Mutants of Sperm Whale Myoglobin 著者: Quillin, M.L. / Arduini, R.M. / Olson, J.S. / Phillips Jr., G.N. #2: ![]() タイトル: Crystal Structure of Myoglobin from a Synthetic Gene 著者: Phillips Jr., G.N. / Arduini, R.M. / Springer, B.A. / Sligar, S.G. #3: ![]() タイトル: High-Level Expression of Sperm Whale Myoglobin in Escherichia Coli 著者: Springer, B.A. / Sligar, S.G. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 46.8 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 32.8 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 821.6 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 828.9 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 11.1 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 15.2 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
類似構造データ |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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Atom site foot note | 1: THIS OXYGEN IS COORDINATED TO FE IN THE HEME GROUP. |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 17390.191 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 参照: UniProt: P02185 |
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#2: 化合物 | ChemComp-SO4 / |
#3: 化合物 | ChemComp-HEM / |
#4: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 3.17 Å3/Da / 溶媒含有率: 61.15 % | |||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS 温度: 20 ℃ / pH: 9 / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法詳細: taken from Phillips, G.N. et al (1990). Proteins. Struct. Funct.Genet., 7, 308. | |||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 1.8 Å / % possible obs: 91.1 % / Rmerge(I) obs: 0.051 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | Rfactor Rwork: 0.153 / Rfactor obs: 0.153 / 最高解像度: 1.9 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 最高解像度: 1.9 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS 最高解像度: 1.9 Å / Rfactor obs: 0.153 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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