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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1kot | ||||||
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タイトル | Solution Structure of Human GABA Receptor Associated Protein GABARAP | ||||||
![]() | GABARAP | ||||||
![]() | TRANSPORT PROTEIN / human GABA Receptor Targeting GABARAP | ||||||
機能・相同性 | ![]() positive regulation of protein K48-linked ubiquitination / regulation of Rac protein signal transduction / GABA receptor binding / phosphatidylethanolamine binding / TBC/RABGAPs / cellular response to nitrogen starvation / microtubule associated complex / Macroautophagy / regulation of neurotransmitter receptor localization to postsynaptic specialization membrane / autophagosome membrane ...positive regulation of protein K48-linked ubiquitination / regulation of Rac protein signal transduction / GABA receptor binding / phosphatidylethanolamine binding / TBC/RABGAPs / cellular response to nitrogen starvation / microtubule associated complex / Macroautophagy / regulation of neurotransmitter receptor localization to postsynaptic specialization membrane / autophagosome membrane / axoneme / extrinsic apoptotic signaling pathway via death domain receptors / autophagosome assembly / autophagosome maturation / beta-tubulin binding / protein targeting / smooth endoplasmic reticulum / mitophagy / sperm midpiece / autophagosome / GABA-ergic synapse / microtubule cytoskeleton organization / positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process / protein transport / actin cytoskeleton / cytoplasmic vesicle / microtubule binding / chemical synaptic transmission / microtubule / lysosome / Golgi membrane / intracellular membrane-bounded organelle / ubiquitin protein ligase binding / plasma membrane / cytosol 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ||||||
![]() | Stangler, T. / Luge, C. / Mayr, L.M. / Willbold, D. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Solution structure of human GABA(A) receptor-associated protein GABARAP: implications for biolgoical funcrion and its regulation. 著者: Stangler, T. / Mayr, L.M. / Willbold, D. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 581.7 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 487 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 341.4 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 474.8 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 52.3 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 69.2 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 14086.176 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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試料調製
詳細 |
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試料状態 | イオン強度: 100mM NaCl 100mM KCl / pH: 6.9 / 圧: ambient / 温度: 298 K | |||||||||
結晶化 | *PLUS 手法: other / 詳細: NMR |
-NMR測定
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M | ||||||||||||||||||||
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放射波長 | 相対比: 1 | ||||||||||||||||||||
NMRスペクトロメーター |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | ||||||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the least restraint violations 計算したコンフォーマーの数: 400 / 登録したコンフォーマーの数: 15 |