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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1ixh | ||||||
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タイトル | PHOSPHATE-BINDING PROTEIN (PBP) COMPLEXED WITH PHOSPHATE | ||||||
![]() | PHOSPHATE-BINDING PROTEIN | ||||||
![]() | PHOSPHATE TRANSPORT / ULTRA HIGH RESOLUTION / PHOSPHATE BINDIN PROTEIN | ||||||
機能・相同性 | ![]() ![]() ![]() ![]() 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Wang, Z. / Luecke, H. / Quiocho, F.A. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: A low energy short hydrogen bond in very high resolution structures of protein receptor--phosphate complexes. 著者: Wang, Z. / Luecke, H. / Yao, N. / Quiocho, F.A. #1: ![]() タイトル: Negative Electrostatic Surface Potential of Protein Sites Specific for Anionic Ligands 著者: Ledvina, P.S. / Yao, N. / Choudhary, A. / Quiocho, F.A. #2: ![]() タイトル: Modulation of a Salt Link Does not Affect Binding of Phosphate to its Specific Active Transport Receptor 著者: Yao, N. / Ledvina, P.S. / Choudhary, A. / Quiocho, F.A. #3: ![]() タイトル: Fine Tuning the Specificity of the Periplasmic Phosphate Transport Receptor. Site-Directed Mutagenesis, Ligand Binding, and Crystallographic Studies 著者: Wang, Z. / Choudhary, A. / Ledvina, P.S. / Quiocho, F.A. #4: ![]() タイトル: The Immunodominant 38-kDa Lipoprotein Antigen of Mycobacterium Tuberculosis is a Phosphate-Binding Protein 著者: Chang, Z. / Choudhary, A. / Lathigra, R. / Quiocho, F.A. #5: ![]() タイトル: High Specificity of a Phosphate Transport Protein Determined by Hydrogen Bonds 著者: Luecke, H. / Quiocho, F.A. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 208.3 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 165 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 34457.598 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() |
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#2: 化合物 | ChemComp-PO4 / ![]() |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.4 Å3/Da / 溶媒含有率: 40 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化![]() | pH: 4.5 / 詳細: pH 4.5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / 詳細: Wang, Z., (1994) J.Biol.Chem., 269, 25091. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 1996年1月1日 |
放射 | 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長![]() |
反射 | 解像度: 0.98→19.4 Å / Num. obs: 147105 / % possible obs: 79.8 % / Observed criterion σ(I): 0 / 冗長度: 9.4 % / Rmerge(I) obs: 0.053 / Net I/σ(I): 35.3 |
反射 シェル | 解像度: 0.98→1 Å / 冗長度: 3.9 % / Rmerge(I) obs: 0.246 / Mean I/σ(I) obs: 3.6 / % possible all: 29.8 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法![]() ![]() 開始モデル: PDB ENTRY 1ABH ![]() 1abh 解像度: 0.98→19.4 Å / Num. parameters: 28413 / Num. restraintsaints: 0 / 交差検証法: FREE R / σ(F): 0
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溶媒の処理 | 溶媒モデル: MOEWS & KRETSINGER | ||||||||||||||||
Refine analyze | Num. disordered residues: 6 / Occupancy sum hydrogen: 547 / Occupancy sum non hydrogen: 3110 | ||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 0.98→19.4 Å
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