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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1ino | ||||||
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タイトル | RECOMBINANT INORGANIC PYROPHOSPHATASE FROM ESCHERICHIA COLI | ||||||
要素 | INORGANIC PYROPHOSPHATASE | ||||||
キーワード | ACID ANHYDRIDE HYDROLASE / METAL BINDING / MN2+ ION / COMPLEX | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 inorganic triphosphate phosphatase activity / inorganic diphosphatase / inorganic diphosphate phosphatase activity / phosphate-containing compound metabolic process / magnesium ion binding / zinc ion binding / membrane / cytosol 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Escherichia coli (大腸菌) | ||||||
手法 | X線回折 / 解像度: 2.2 Å | ||||||
データ登録者 | Oganesyan, V.Yu. / Avaeva, S.M. / Harutyunyan, E.H. | ||||||
引用 | ジャーナル: Febs Lett. / 年: 1995 タイトル: Mg2+ activation of Escherichia coli inorganic pyrophosphatase. 著者: Avaeva, S.M. / Rodina, E.V. / Kurilova, S.A. / Nazarova, T.I. / Vorobyeva, N.N. / Harutyunyan, E.H. / VYu, Oganessyan | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1ino.cif.gz | 50 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1ino.ent.gz | 36 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1ino.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 1ino_validation.pdf.gz | 364.8 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 1ino_full_validation.pdf.gz | 372.5 KB | 表示 | |
XML形式データ | 1ino_validation.xml.gz | 6.1 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 1ino_validation.cif.gz | 8.9 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/in/1ino ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/in/1ino | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
| x 6|||||||||
単位格子 |
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Atom site foot note | 1: CIS PROLINE - PRO 12 | |||||||||
Components on special symmetry positions |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 19597.334 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Escherichia coli (大腸菌) / 株: JM109 / プラスミド: PUC19 / 遺伝子 (発現宿主): PYROPHOSPHATASE ESCHERICHIA COLI / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P0A7A9, inorganic diphosphatase |
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#2: 化合物 | ChemComp-MN / |
#3: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: X線回折 |
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-試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.3 Å3/Da / 溶媒含有率: 46.44 % |
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結晶化 | *PLUS 手法: unknown |
-データ収集
放射光源 | 波長: 1.5418 Å |
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検出器 | 検出器: 2DIMENSION-GAS CAMERA/INSTITUTE OF CRYSTALLOGRAPHY,MOSCOW 日付: 1994年10月1日 |
放射 | 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | Num. obs: 8948 / % possible obs: 97.4 % / Rmerge(I) obs: 0.08 |
-解析
ソフトウェア | 名称: PROLSQ / 分類: 精密化 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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精密化 | 解像度: 2.2→12 Å / σ(F): 0 /
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原子変位パラメータ | Biso mean: 21.66 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.2→12 Å
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拘束条件 |
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