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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1ima | ||||||
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タイトル | STRUCTURAL ANALYSIS OF INOSITOL MONOPHOSPHATASE COMPLEXES WITH SUBSTRATES | ||||||
要素 | INOSITOL MONOPHOSPHATASE | ||||||
キーワード | HYDROLASE | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 D-galactose 1-phosphate phosphatase / inositol monophosphate phosphatase activity / Synthesis of IP2, IP, and Ins in the cytosol / lithium ion binding / inositol biosynthetic process / inositol-phosphate phosphatase / inositol monophosphate 3-phosphatase activity / inositol monophosphate 4-phosphatase activity / inositol monophosphate 1-phosphatase activity / inositol metabolic process ...D-galactose 1-phosphate phosphatase / inositol monophosphate phosphatase activity / Synthesis of IP2, IP, and Ins in the cytosol / lithium ion binding / inositol biosynthetic process / inositol-phosphate phosphatase / inositol monophosphate 3-phosphatase activity / inositol monophosphate 4-phosphatase activity / inositol monophosphate 1-phosphatase activity / inositol metabolic process / phosphatidylinositol biosynthetic process / phosphate-containing compound metabolic process / phosphatidylinositol phosphate biosynthetic process / manganese ion binding / magnesium ion binding / signal transduction / protein homodimerization activity / identical protein binding / cytoplasm / cytosol 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Homo sapiens (ヒト) | ||||||
手法 | X線回折 / 解像度: 2.3 Å | ||||||
データ登録者 | Bone, R. | ||||||
引用 | ジャーナル: Biochemistry / 年: 1994 タイトル: Structural analysis of inositol monophosphatase complexes with substrates. 著者: Bone, R. / Frank, L. / Springer, J.P. / Pollack, S.J. / Osborne, S.A. / Atack, J.R. / Knowles, M.R. / McAllister, G. / Ragan, C.I. / Broughton, H.B. / Baker, R. / Fletcher, S.R. #1: ジャーナル: Biochem.J. / 年: 1992 タイトル: Cdna Cloning of Human and Rat Brain Myo-Inositol Monophosphatase. Expression and Characterization of the Human Recombinant Enzyme 著者: Mcallister, G. / Whiting, P. / Hammond, E.A. / Knowles, M.R. / Atack, J.R. / Bailey, F.J. / Maigetter, R. / Ragan, C.I. #2: ジャーナル: Proc.Natl.Acad.Sci.USA / 年: 1992 タイトル: Structure of Inositol Monophosphatase, the Putative Target of Lithium Therapy 著者: Bone, R. / Springer, J.P. / Atack, J.R. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1ima.cif.gz | 113.6 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1ima.ent.gz | 94.2 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1ima.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 1ima_validation.pdf.gz | 394.5 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 1ima_full_validation.pdf.gz | 400 KB | 表示 | |
XML形式データ | 1ima_validation.xml.gz | 11.7 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 1ima_validation.cif.gz | 18.6 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/im/1ima ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/im/1ima | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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単位格子 |
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Atom site foot note | 1: CIS PROLINE - PRO A 186 / 2: CIS PROLINE - PRO B 186 |
-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 30219.781 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: CDNA / 器官: BRAIN / 参照: UniProt: P29218, inositol-phosphate phosphatase #2: 化合物 | #3: 化合物 | #4: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: X線回折 |
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-試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.79 Å3/Da / 溶媒含有率: 55.84 % | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / 詳細: Bone, R., (1992) Proc.Nat.Acad.Sci.USA, 89, 10031. / pH: 7.8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 2.3 Å / 最低解像度: 8 Å / % possible obs: 93 % / Observed criterion σ(I): 13.1 / Rmerge(I) obs: 0.079 |
-解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2.3→8 Å / Rfactor Rwork: 0.181 / Rfactor obs: 0.181 / σ(F): 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.3→8 Å
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拘束条件 |
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