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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1hvw | ||||||
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タイトル | HAIRPINLESS MUTANT OF OMEGA-ATRACOTOXIN-HV1A | ||||||
要素 | OMEGA-ATRACOTOXIN-HV1A | ||||||
キーワード | TOXIN / cystine knot / beta-hairpin | ||||||
機能・相同性 | Omega-atracotoxin / Omega-atracotoxin, conserved site / Omega-atracotoxin / Omega-atracotoxin (ACTX) type 1 family signature. / calcium channel inhibitor activity / defense response / toxin activity / extracellular region / Omega-hexatoxin-Hv1a 機能・相同性情報 | ||||||
手法 | 溶液NMR / Torsion angle dynamics, dynamical simulated annealing | ||||||
データ登録者 | Fletcher, J.I. / King, G.F. | ||||||
引用 | ジャーナル: J.Biol.Chem. / 年: 2001 タイトル: Functional significance of the beta hairpin in the insecticidal neurotoxin omega-atracotoxin-Hv1a. 著者: Tedford, H.W. / Fletcher, J.I. / King, G.F. #1: ジャーナル: Nat.Struct.Biol. / 年: 1997 タイトル: The Structure of a Novel Insecticidal Neurotoxin, Omega-Atracotoxin-HV1, from the Venom of an Australian Funnel Web Spider 著者: Fletcher, J.I. / Smith, R. / O'Donoghue, S.I. / Nilges, M. / Connor, M. / Howden, M.E. / Christie, M.J. / King, G.F. #2: ジャーナル: Eur.J.Biochem. / 年: 1999 タイトル: Structure-function Studies of Omega-atracotoxin, A Potent Antagonist of Insect Voltage-gated Calcium Channels 著者: Wang, X. / Smith, R. / Fletcher, J.I. / Wilson, H. / Wood, C.J. / Howden, M.E. / King, G.F. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1hvw.cif.gz | 111.9 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1hvw.ent.gz | 88.1 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1hvw.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 1hvw_validation.pdf.gz | 333 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 1hvw_full_validation.pdf.gz | 413.9 KB | 表示 | |
XML形式データ | 1hvw_validation.xml.gz | 7.8 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 1hvw_validation.cif.gz | 12.8 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/hv/1hvw ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/hv/1hvw | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質・ペプチド | 分子量: 2623.899 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 詳細: This peptide was chemically synthesized. The native peptide is naturally found in Hadronyche versuta (Blue mountain funnel-web spider).The mutant hairpinless toxin was synthesized by solid- ...詳細: This peptide was chemically synthesized. The native peptide is naturally found in Hadronyche versuta (Blue mountain funnel-web spider).The mutant hairpinless toxin was synthesized by solid-phase peptide synthesis, oxidized/folded in a glutathione redox buffer, then purified using reverse-phase HPLC. 参照: UniProt: P56207 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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NMR実験の詳細 | Text: This structure was determined using standard 2D homonuclear techniques. |
-試料調製
詳細 |
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試料状態 | イオン強度: 0.005 / pH: 4.9 / 圧: 1 atm / 温度: 298 K | |||||||||
結晶化 | *PLUS 手法: other / 詳細: NMR |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker DRX / 製造業者: Bruker / モデル: DRX / 磁場強度: 600 MHz |
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-解析
NMR software |
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精密化 | 手法: Torsion angle dynamics, dynamical simulated annealing ソフトェア番号: 1 詳細: The structures are based on a total of 231 NOE-derived distance restraints, 19 dihedral-angle restraints, and 16 restraints defining 8 hydrogen bonds. | ||||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | ||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |