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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1ho0 | ||||||
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タイトル | NEW B-CHAIN MUTANT OF BOVINE INSULIN | ||||||
要素 | INSULIN | ||||||
キーワード | HORMONE/GROWTH FACTOR / BETA_TURN (20-23) / ALPHA_HELIX (9-19) / HORMONE-GROWTH FACTOR COMPLEX | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 estradiol secretion / negative regulation of lactation / positive regulation of blood circulation / glucose import in response to insulin stimulus / positive regulation of cell maturation / positive regulation of lactation / response to L-arginine / positive regulation of mammary gland epithelial cell proliferation / negative regulation of appetite / response to butyrate ...estradiol secretion / negative regulation of lactation / positive regulation of blood circulation / glucose import in response to insulin stimulus / positive regulation of cell maturation / positive regulation of lactation / response to L-arginine / positive regulation of mammary gland epithelial cell proliferation / negative regulation of appetite / response to butyrate / feeding behavior / response to growth hormone / response to food / positive regulation of Rho protein signal transduction / positive regulation of peptide hormone secretion / protein secretion / negative regulation of lipid catabolic process / response to glucose / response to nutrient levels / positive regulation of protein secretion / insulin receptor binding / positive regulation of insulin secretion / hormone activity / glucose metabolic process / glucose homeostasis / response to heat / positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase/protein kinase B signal transduction / positive regulation of gene expression / negative regulation of apoptotic process / extracellular space / identical protein binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ||||||
データ登録者 | Dupradeau, F.Y. / Richard, T. / Le Flem, G. / Oulyadi, H. / Prigent, Y. / Monti, J.P. | ||||||
引用 | ジャーナル: J.Pept.Res. / 年: 2002 タイトル: A new B-chain mutant of insulin: comparison with the insulin crystal structure and role of sulfonate groups in the B-chain structure 著者: Dupradeau, F.Y. / Richard, T. / Le Flem, G. / Oulyadi, H. / Prigent, Y. / Monti, J.P. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1ho0.cif.gz | 201 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1ho0.ent.gz | 169.7 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1ho0.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 1ho0_validation.pdf.gz | 357.1 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 1ho0_full_validation.pdf.gz | 464 KB | 表示 | |
XML形式データ | 1ho0_validation.xml.gz | 11.5 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 1ho0_validation.cif.gz | 19.3 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ho/1ho0 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ho/1ho0 | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質・ペプチド | 分子量: 3371.797 Da / 分子数: 1 / 断片: B-CHAIN / 変異: C7S, C19S / 由来タイプ: 合成 詳細: THIS PEPTIDE WAS CHEMICALLY SYNTHESIZED. IT WAS Obtained by solid phase synthesis using a peptide synthesizer. 参照: UniProt: P01317 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||
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NMR実験 |
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NMR実験の詳細 | Text: This family of structures was determined using standard 2D homonuclear techniques. |
-試料調製
詳細 | 内容: 0.5 mM peptide concentration / 溶媒系: 70 % H2O / 30 % deuterated TFE |
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試料状態 | イオン強度: 0 / pH: 3.6 / 圧: ambient / 温度: 293 K |
結晶化 | *PLUS 手法: other / 詳細: NMR |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker DRX / 製造業者: Bruker / モデル: DRX / 磁場強度: 600 MHz |
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-解析
NMR software |
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精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 詳細: These structures are based on a total of 286 restraints: 243 are NOE-derived distance constraints, 39 dihedral angle restraints and 4 distance restraints from hydrogen bonds. | ||||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: closest to the average | ||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the least restraint violations, structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 21 |