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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1gab | ||||||
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タイトル | STRUCTURE OF AN ALBUMIN-BINDING DOMAIN, NMR, 20 STRUCTURES | ||||||
要素 | PROTEIN PAB | ||||||
キーワード | ALBUMIN-BINDING PROTEIN / BACTERIAL SURFACE PROTEINS / EVOLUTION / MODULE SHUFFLING | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 | ||||||
生物種 | Finegoldia magna ATCC 29328 (バクテリア) | ||||||
手法 | 溶液NMR / DETAILS OF THE STRUCTURE DETERMINATION, ALL STRUCTURAL STATISTICS ARE GIVEN IN THE PAPER CITED ON THE JRNL RECORDS ABOVE. THE STRUCTURES ARE BASED ON 649 INTERPROTON DISTANCE CONSTRAINTS, 26 DIHEDRAL CONSTRAINTS. NO HYDROGEN BOND CONSTRAINTS WERE USED. | ||||||
データ登録者 | Johansson, M.U. / De Chateau, M. / Wikstrom, M. / Forsen, S. / Drakenberg, T. / Bjorck, L. | ||||||
引用 | ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 1997 タイトル: Solution structure of the albumin-binding GA module: a versatile bacterial protein domain. 著者: Johansson, M.U. / de Chateau, M. / Wikstrom, M. / Forsen, S. / Drakenberg, T. / Bjorck, L. #1: ジャーナル: FEBS Lett. / 年: 1995 タイトル: The Ga Module, a Mobile Albumin-Binding Bacterial Domain, Adopts a Three-Helix-Bundle Structure 著者: Johansson, M.U. / De Chateau, M. / Bjorck, L. / Forsen, S. / Drakenberg, T. / Wikstrom, M. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1gab.cif.gz | 331.5 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1gab.ent.gz | 276.4 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1gab.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 1gab_validation.pdf.gz | 345.7 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 1gab_full_validation.pdf.gz | 510.1 KB | 表示 | |
XML形式データ | 1gab_validation.xml.gz | 30.7 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 1gab_validation.cif.gz | 45.1 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ga/1gab ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ga/1gab | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 5939.786 Da / 分子数: 1 / 断片: ALBUMIN-BINDING DOMAIN, RESIDUES 213 - 265 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) Finegoldia magna ATCC 29328 (バクテリア) 生物種: Finegoldia magna / 株: ALB8 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: Q51911 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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-試料調製
試料状態 | pH: 6 / 温度: 300 K |
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結晶化 | *PLUS 手法: other / 詳細: NMR |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター |
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-解析
ソフトウェア |
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NMR software |
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精密化 | 手法: DETAILS OF THE STRUCTURE DETERMINATION, ALL STRUCTURAL STATISTICS ARE GIVEN IN THE PAPER CITED ON THE JRNL RECORDS ABOVE. THE STRUCTURES ARE BASED ON 649 INTERPROTON DISTANCE CONSTRAINTS, 26 ...手法: DETAILS OF THE STRUCTURE DETERMINATION, ALL STRUCTURAL STATISTICS ARE GIVEN IN THE PAPER CITED ON THE JRNL RECORDS ABOVE. THE STRUCTURES ARE BASED ON 649 INTERPROTON DISTANCE CONSTRAINTS, 26 DIHEDRAL CONSTRAINTS. NO HYDROGEN BOND CONSTRAINTS WERE USED. ソフトェア番号: 2 | ||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the least restraint violations 計算したコンフォーマーの数: 200 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |