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データを開く
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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1fys | ||||||
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タイトル | Ribonuclease T1 V16C mutant | ||||||
![]() | GUANYL-SPECIFIC RIBONUCLEASE T1 | ||||||
![]() | HYDROLASE / ribonuclease | ||||||
機能・相同性 | ![]() hyphal tip / ribonuclease T1 activity / ribonuclease T1 / cell septum / endonuclease activity / lyase activity / RNA binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | De Vos, S. / Loris, R. / Steyaert, J. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Hydrophobic core manipulations in ribonuclease T1. 著者: De Vos, S. / Backmann, J. / Prevost, M. / Steyaert, J. / Loris, R. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 30.5 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 22.2 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 784 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 784.2 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 7.3 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 9.4 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 11098.707 Da / 分子数: 1 / 変異: V16C / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() | ||||
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#2: 化合物 | #3: 化合物 | ChemComp-2GP / | #4: 水 | ChemComp-HOH / | |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.2 Å3/Da / 溶媒含有率: 44.16 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | 温度: 298 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 4.5 詳細: MPD, Na-acetate, calcium chloride, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS pH: 4.2 / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / 詳細: Zegers, I., (1998) Nat.Struct.Biol., 5, 280. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 298 K |
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放射光源 | 由来: ![]() |
検出器 | タイプ: MARRESEARCH / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 1999年10月3日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2→20 Å / Num. all: 6601 / Num. obs: 6601 / % possible obs: 94.3 % / Observed criterion σ(F): -6 / Observed criterion σ(I): -3 / 冗長度: 4.07 % / Biso Wilson estimate: 13.4 Å2 / Rmerge(I) obs: 0.127 / Net I/σ(I): 9.22 |
反射 シェル | 解像度: 2→2.07 Å / 冗長度: 3.8 % / Rmerge(I) obs: 0.349 / Num. unique all: 587 / % possible all: 85.9 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 2 Å / Num. obs: 6623 / Num. measured all: 26858 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2→2.09 Å / σ(F): 0 / σ(I): 0 / 立体化学のターゲット値: Engh & Huber
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2→2.09 Å
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拘束条件 |
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