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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1d6t | ||||||
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タイトル | RNASE P PROTEIN FROM STAPHYLOCOCCUS AUREUS | ||||||
要素 | RIBONUCLEASE P | ||||||
キーワード | HYDROLASE / ENDONUCLEASE / RNASE / SUBUNIT | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 3'-tRNA processing endoribonuclease activity / ribonuclease P complex / ribonuclease P / ribonuclease P activity / tRNA 5'-leader removal / tRNA binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌) | ||||||
手法 | 溶液NMR | ||||||
データ登録者 | Spitzfaden, C. | ||||||
引用 | ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 2000 タイトル: The structure of ribonuclease P protein from Staphylococcus aureus reveals a unique binding site for single-stranded RNA. 著者: Spitzfaden, C. / Nicholson, N. / Jones, J.J. / Guth, S. / Lehr, R. / Prescott, C.D. / Hegg, L.A. / Eggleston, D.S. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1d6t.cif.gz | 378.6 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1d6t.ent.gz | 308.4 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1d6t.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 1d6t_validation.pdf.gz | 342 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 1d6t_full_validation.pdf.gz | 596.2 KB | 表示 | |
XML形式データ | 1d6t_validation.xml.gz | 83.4 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 1d6t_validation.cif.gz | 107.7 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/d6/1d6t ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/d6/1d6t | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 13684.336 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌) 生物種 (発現宿主): Escherichia coli / 発現宿主: Escherichia coli BL21 (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21 / 参照: UniProt: P0A0H5, ribonuclease P |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR |
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-試料調製
詳細 | 内容: 1.5mM RNAseP protein, U-15N,13C, pH 6.0, (500mM sodium chloride, 20mM sodium acetate, 20mM sodium phosphate) 溶媒系: 95% H2O/5% D2O |
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結晶化 | *PLUS 手法: other / 詳細: NMR |
-解析
代表構造 | 選択基準: fewest violations |
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NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the least restraint violations 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |