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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1d0w | ||||||
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タイトル | SOLUTION STRUCTURE OF LACTAM-BRIDGED C-TERMINAL ANALOGUE-I OF NEUROPEPTIDE Y | ||||||
![]() | C-TERMINAL ANALOGUE OF NEUROPEPTIDE Y, A POTENT Y2 RECEPTOR AGONIST | ||||||
![]() | NEUROPEPTIDE / LACTAM-BRIDGED / HELIX | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ||||||
![]() | Yao, S. / Norton, R.S. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Stabilization of the helical structure of Y2-selective analogues of neuropeptide Y by lactam bridges. 著者: Yao, S. / Smith-White, M.A. / Potter, E.K. / Norton, R.S. #1: ![]() タイトル: Helical structure and self-association in a 13-residue neuropeptide Y Y2 receptor agonist: relationship to biological activity 著者: Barnham, K.J. / Catalfamo, F. / Pallaghy, P.K. / Howlett, G.J. / Norton, R.S. #2: ![]() タイトル: Solution structure of human neuropeptide Y 著者: Monks, S.A. / Karagianis, G. / Howlett, G.J. / Norton, R.S. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 93 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 71.5 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 352.4 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 456.5 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 7.1 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 10.6 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質・ペプチド | 分子量: 1792.054 Da / 分子数: 1 / 断片: C-TERMINAL ANALOGUE 変異: L24A, I28K, I31L, T32E, A LACTAM-BRIDGE WAS INTRODUCED BETWEEN POSITIONS (28) AND (32) 由来タイプ: 合成 / 詳細: Chemically synthesized. |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||
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NMR実験 |
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NMR実験の詳細 | Text: THIS STRUCTURE WAS DETERMINED USING STANDARD 2D HOMONUCLEAR TECHNIQUES. |
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試料調製
詳細 | 内容: 3.5 MG IN 0.6 ML H2O CONTAINING 30% TFE-D3 (BY VOLUME) |
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試料状態 | pH: 5.0 / 圧: 1 atm / 温度: 308 K |
結晶化 | *PLUS 手法: other / 詳細: NMR |
-NMR測定
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M | |||||||||||||||
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放射波長 | 相対比: 1 | |||||||||||||||
NMRスペクトロメーター |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 詳細: THE STRUCTURE WAS CALCULATED USING A TOTAL OF 124 UPPER BOUND DISTANCE RESTRAINTS AND 8 BACKBONE DIHEDRAL ANGLE CONSTRAINTS | ||||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: closest to the average | ||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |