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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1cpr | ||||||
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タイトル | ST. LOUIS CYTOCHROME C' FROM THE PURPLE PHOTOTROPIC BACTERIUM, RHODOBACTER CAPSULATUS | ||||||
![]() | CYTOCHROME C' | ||||||
![]() | ELECTRON TRANSPORT / HEME PROTEIN / CYTOCHROME | ||||||
機能・相同性 | ![]() electron transport chain / periplasmic space / electron transfer activity / iron ion binding / heme binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||
![]() | Tahirov, T.H. / Misaki, S. / Meyer, T.E. / Cusanovich, M.A. / Yasuoka, N. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structure of cytochrome c' from Rhodobacter capsulatus strain St Louis: an unusual molecular association induced by bridging Zn ions. 著者: Tahirov, T.H. / Misaki, S. / Meyer, T.E. / Cusanovich, M.A. / Higuchi, Y. / Yasuoka, N. #1: ![]() タイトル: High-Resolution Crystal Structures of Two Polymorphs of Cytochrome C' from the Purple Phototrophic Bacterium Rhodobacter Capsulatus 著者: Tahirov, T.H. / Misaki, S. / Meyer, T.E. / Cusanovich, M.A. / Higuchi, Y. / Yasuoka, N. #2: ![]() タイトル: Concerted Movement of Side Chains in the Haem Vicinity Observed on Ligand Binding in Cytochrome C' from Rhodobacter Capsulatus 著者: Tahirov, T.H. / Misaki, S. / Meyer, T.E. / Cusanovich, M.A. / Higuchi, Y. / Yasuoka, N. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 32.7 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 25.7 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 786 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 786.3 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 7.9 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 9.9 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 13140.707 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) ![]() | ||||
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#2: 化合物 | ChemComp-ZN / #3: 化合物 | ChemComp-HEM / | #4: 水 | ChemComp-HOH / | |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.69 Å3/Da / 溶媒含有率: 51 % | |||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS pH: 6.5 / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 | |||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
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検出器 | タイプ: FUJI / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 1995年12月19日 |
放射 | 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1 Å / 相対比: 1 |
反射 | Num. obs: 6988 / % possible obs: 85.2 % / Observed criterion σ(I): -3 / 冗長度: 3.88 % / Rmerge(I) obs: 0.08 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 2.1 Å / 最低解像度: 30 Å / Num. measured all: 27125 |
反射 シェル | *PLUS 最高解像度: 2.1 Å / 最低解像度: 2.18 Å / % possible obs: 66.4 % / Rmerge(I) obs: 0.19 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2.1→6 Å / σ(F): 2 /
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原子変位パラメータ | Biso mean: 21.99 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.1→6 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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