+データを開く
-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1clc | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
タイトル | THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF ENDOGLUCANASE D AT 1.9 ANGSTROMS RESOLUTION | ||||||
要素 | ENDOGLUCANASE CELD; EC: 3.2.1.4 | ||||||
キーワード | GLYCOSYL HYDROLASE / CELLULASE / ENDOGLUCANASE | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 | ||||||
生物種 | Clostridium thermocellum (バクテリア) | ||||||
手法 | X線回折 / シンクロトロン / 解像度: 1.9 Å | ||||||
データ登録者 | Alzari, P.M. / Lascombe, M.B. | ||||||
引用 | ジャーナル: To be Published タイトル: Three-Dimensional Structure of Endoglucanase D at 1.9 Angstroms Resolution 著者: Lascombe, M.B. / Souchon, H. / Juy, M. / Alzari, P.M. #1: ジャーナル: FOUND.BIOTECH.IND.FERMENT.RES.[PUBL.] / 年: 1993 タイトル: Endoglucanase Celd from Clostridium Thermocellum: An Unusual Structure for a Canonical Mechanism 著者: Alzari, P.M. / Juy, M. / Souchon, H. #2: ジャーナル: Nature / 年: 1992 タイトル: Three-Dimensional Structure of a Thermostable Bacterial Cellulase 著者: Juy, M. / Amit, A.G. / Alzari, P.M. / Poljak, R.J. / Claeyssens, M. / Beguin, P. / Aubert, J.-P. | ||||||
履歴 |
|
-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
---|
-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1clc.cif.gz | 130.5 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
---|---|---|---|---|
PDB形式 | pdb1clc.ent.gz | 97.7 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1clc.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 1clc_validation.pdf.gz | 370.7 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
---|---|---|---|---|
文書・詳細版 | 1clc_full_validation.pdf.gz | 375.5 KB | 表示 | |
XML形式データ | 1clc_validation.xml.gz | 11.6 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 1clc_validation.cif.gz | 19.9 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/cl/1clc ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/cl/1clc | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
| ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 |
| ||||||||
単位格子 |
| ||||||||
Atom site foot note | 1: ASP 177 - ALA 178 OMEGA = 358.90 CIS PEPTIDE BOND. / 2: CIS PROLINE - PRO 539 |
-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 71276.320 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) Clostridium thermocellum (バクテリア) 株: NCIB 10682; EXPRESSION_SYSTEM: ESCHERICHIA COLI / プラスミド: PCT603 (PUC8) / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P04954, UniProt: P0C2S4*PLUS, cellulase | ||||
---|---|---|---|---|---|
#2: 化合物 | #3: 化合物 | ChemComp-ZN / | #4: 水 | ChemComp-HOH / | |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: X線回折 |
---|
-試料調製
結晶 | マシュー密度: 3.79 Å3/Da / 溶媒含有率: 67.54 % |
---|
-データ収集
放射光源 | 由来: シンクロトロン / サイト: EMBL/DESY, HAMBURG / ビームライン: X11 / 波長: 0.927 |
---|---|
検出器 | タイプ: MARRESEARCH / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 1994年7月14日 |
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 0.927 Å / 相対比: 1 |
反射 | Num. obs: 81881 / % possible obs: 95.2 % / 冗長度: 2.9 % / Rmerge(I) obs: 0.068 |
-解析
ソフトウェア |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
精密化 | 解像度: 1.9→7 Å / σ(F): 2 /
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.9→7 Å
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 |
|